RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402583.5

CBX1-203, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene CBX1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-203ENST00000402583 SMAPO00193 183 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 RNF8O76064 485 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 GJB6O95452 261 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 ITGAVP06756 1048 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 GJB1P08034 283 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 ABHD2P08910 425 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 IVDP26440 423 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 KLRC2P26717 231 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 GJA5P36382 358 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 GRM5P41594 1212 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 GABRB2P47870 512 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 VCPP55072 806 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 NR1H3Q13133 447 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 HIC1Q14526 733 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 LLGL1Q15334 1064 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 GRIK4Q16099 956 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 CCL15Q16663 113 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 DGKDQ16760 1214 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 ERMARDQ5T6L9 678 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 CYP4A22Q5TCH4 519 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 KAZNQ674X7 775 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 MFSD7Q6UXD7 560 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 CPLX4Q7Z7G2 160 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 OTUD6BQ8N6M0 293 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 ALLCQ8N6M5 410 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 CEP120Q8N960 986 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 SLC4A11Q8NBS3 891 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 OR6J1Q8NGC5 347 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 RAPGEF5Q92565 580 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 CHMP6Q96FZ7 201 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 CFAP57Q96MR6 1250 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 NCAPGQ9BPX3 1015 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 HERPUD2Q9BSE4 406 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 RABEP2Q9H5N1 569 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 PPCSQ9HAB8 311 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 DPP3Q9NY33 737 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 SIX4Q9UIU6 781 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 AGAP1Q9UPQ3 857 aa9.8□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 A0A1B0GUA9 196 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 C5orf60A6NFR6 353 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 PI4K2BG5E9Z4 385 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 M0QYV0 167 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 O00370 1275 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 TSPAN1O60635 241 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 MICAL2O94851 1124 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 ACSL3O95573 720 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 MMP3P08254 477 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 ZNF286BP0CG31 522 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 SETSIPP0DME0 302 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 CHN1P15882 459 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 ADCYAP1R1P41586 468 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 CDKN2BP42772 138 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 RAP1GAPP47736 663 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 VPS41P49754 854 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 ARSEP51690 589 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 SEC24CP53992 1094 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 YARSP54577 528 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 PLCB3Q01970 1234 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 INCA1Q0VD86 236 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 IRF5Q13568 498 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 AUHQ13825 339 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 MORF4L2Q15014 288 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 P3H1Q32P28 736 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 SLC10A6Q3KNW5 377 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 DUSP28Q4G0W2 176 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 PTPN20Q4JDL3 420 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 XYLT1Q86Y38 959 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 P3H4Q92791 437 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 CPB2Q96IY4 423 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 TSPAN18Q96SJ8 248 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 C16orf70Q9BSU1 422 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 SYT17Q9BSW7 474 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 NT5C1AQ9BXI3 368 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.79□□□□□ -0.84
CBX1-203ENST00000402583 SMYD3Q9H7B4 428 aa9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms