RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 MLKLQ8NB16 471 aa23.5■■□□□ 1.35
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IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM200AQ8TCP9 573 aa23.5■■□□□ 1.35
IGHV3-20-201ENST00000390606 GPR152Q8TDT2 470 aa23.5■■□□□ 1.35
IGHV3-20-201ENST00000390606 FGF14Q92915 247 aa23.5■■□□□ 1.35
IGHV3-20-201ENST00000390606 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
IGHV3-20-201ENST00000390606 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
IGHV3-20-201ENST00000390606 IL21Q9HBE4 155 aa23.5■■□□□ 1.35
IGHV3-20-201ENST00000390606 RAB20Q9NX57 234 aa23.5■■□□□ 1.35
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
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IGHV3-20-201ENST00000390606 TEAD2Q15562 447 aa23.49■■□□□ 1.35
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC40Q4G0X9 1142 aa23.49■■□□□ 1.35
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIM67Q6ZTA4 783 aa23.49■■□□□ 1.35
IGHV3-20-201ENST00000390606 UBALD2Q8IYN6 164 aa23.49■■□□□ 1.35
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IGHV3-20-201ENST00000390606 BDNFP23560 247 aa23.48■■□□□ 1.35
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IGHV3-20-201ENST00000390606 ASIC4Q96FT7 647 aa23.47■■□□□ 1.35
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAXDC2Q96IV6 333 aa23.47■■□□□ 1.35
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IGHV3-20-201ENST00000390606 CSH2P0DML3 217 aa23.46■■□□□ 1.35
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IGHV3-20-201ENST00000390606 GRIK1P39086 918 aa23.44■■□□□ 1.34
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IGHV3-20-201ENST00000390606 WDR44Q5JSH3 913 aa23.44■■□□□ 1.34
IGHV3-20-201ENST00000390606 TANGO2Q6ICL3 276 aa23.44■■□□□ 1.34
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IGHV3-20-201ENST00000390606 SPATA17Q96L03 361 aa23.44■■□□□ 1.34
IGHV3-20-201ENST00000390606 CEP295NLQ96MC4 621 aa23.44■■□□□ 1.34
IGHV3-20-201ENST00000390606 KXD1Q9BQD3 176 aa23.44■■□□□ 1.34
IGHV3-20-201ENST00000390606 GPR88Q9GZN0 384 aa23.44■■□□□ 1.34
IGHV3-20-201ENST00000390606 ELOVL4Q9GZR5 314 aa23.44■■□□□ 1.34
IGHV3-20-201ENST00000390606 F8VP50 259 aa23.43■■□□□ 1.34
IGHV3-20-201ENST00000390606 ECI2O75521 394 aa23.43■■□□□ 1.34
IGHV3-20-201ENST00000390606 MBD3O95983 291 aa23.43■■□□□ 1.34
IGHV3-20-201ENST00000390606 SRFP11831 508 aa23.43■■□□□ 1.34
IGHV3-20-201ENST00000390606 CYP4F8P98187 520 aa23.43■■□□□ 1.34
IGHV3-20-201ENST00000390606 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa23.43■■□□□ 1.34
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM35AQ86V20 835 aa23.43■■□□□ 1.34
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