RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 DACT1Q9NYF0 836 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 LRFN1Q9P244 771 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 CRYL1Q9Y2S2 319 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa6.34□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 THSD7BQ9C0I4 1608 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 RPTORQ8N122 1335 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 PCNTO95613 3336 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 ZNF839A8K0R7 811 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 F8W8V4 182 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 MBD4O95243 580 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 GPTP24298 496 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 FOXO1Q12778 655 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SSPNQ14714 243 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 FAAH2Q6GMR7 532 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 FAM129CQ86XR2 697 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 IQCDQ96DY2 449 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 CRAMP1Q96RY5 1269 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 EYA3Q99504 573 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SLC26A6Q9BXS9 759 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 OR10A5Q9H207 317 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 MAGEH1Q9H213 219 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 MYO1AQ9UBC5 1043 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SLC39A10Q9ULF5 831 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 KCTD3Q9Y597 815 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 RFXAPO00287 272 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 NUAK1O60285 661 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 MYL6BP14649 208 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SYN1P17600 705 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 PI3P19957 117 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 MALP21145 153 aa6.32□□□□□ -1.4
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CCL20-201ENST00000358813 ECHS1P30084 290 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 PRKAR2BP31323 418 aa6.32□□□□□ -1.4
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CCL20-201ENST00000358813 MAN2A1Q16706 1144 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 DGKDQ16760 1214 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 PARP10Q53GL7 1025 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 ZNF385BQ569K4 471 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 CFAP161Q6P656 301 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 FAM9BQ8IZU0 186 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 FANCBQ8NB91 859 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 TMX3Q96JJ7 454 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 RNF186Q9NXI6 227 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 PCDHA6Q9UN73 950 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 USP16Q9Y5T5 823 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 BCORQ6W2J9 1755 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 KIF7Q2M1P5 1343 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 LTBP1Q14766 1721 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 TRPM7Q96QT4 1865 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 ERVV-1B6SEH8 477 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SYT5O00445 386 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 BBOX1O75936 387 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 LRG1P02750 347 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 NCAM1P13591 858 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 RPS12P25398 132 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 CTSSP25774 331 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 CFPP27918 469 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 MPP1Q00013 466 aa6.31□□□□□ -1.4
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