RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SPPL3Q8TCT6 385 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 HAS1Q92839 578 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM175Q9BSA9 504 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 IFT122Q9HBG6 1241 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ERVK-5Q9HDB9 667 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 HPSEQ9Y251 543 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SCN4AP35499 1836 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D3EA0A087X179 549 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D3LB9A6J9 549 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 F5H5T6 163 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PRPSAP2O60256 369 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 FSBPO95073 299 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 PRR29P0C7W0 189 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D3HP0C7X1 549 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CTSEP14091 401 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MUTP22033 750 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GRM5P41594 1212 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ERVFC1P60507 584 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 POM121L1PQ3SYA9 428 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 LUZP1Q86V48 1076 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MAP7D3Q8IWC1 876 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ACDQ96AP0 544 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 HVCN1Q96D96 273 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CALN1Q9BXU9 219 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ABCF3Q9NUQ8 709 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PIAS3Q9Y6X2 628 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CACNA1EQ15878 2313 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ASTN1O14525 1302 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 NFICP08651 508 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CTSAP10619 480 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SCP2P22307 547 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CYP3A7P24462 503 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CYP2F1P24903 491 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TEAD2Q15562 447 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TMC6Q7Z403 805 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DSG4Q86SJ6 1040 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM86AQ8N2M4 240 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SPIRE2Q8WWL2 714 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 RTP3Q9BQQ7 232 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 NIF3L1Q9GZT8 377 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SP110Q9HB58 689 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DDIT4Q9NX09 232 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MARCH2Q9P0N8 246 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 IGSF9Q9P2J2 1179 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D14Q9P2M4 693 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 SORCS3Q9UPU3 1222 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 A0A087X0B3 334 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 HIDE1A8MVS5 230 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 C9IYK1 514 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MYO1FO00160 1098 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SYN3O14994 580 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GFPT2O94808 682 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 EPHX1P07099 455 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DCNP07585 359 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GUCY2CP25092 1073 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GNA15P30679 374 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 RAP1GAPP47736 663 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CASP4P49662 377 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 NLRP12P59046 1061 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MYL5Q02045 173 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TAF10Q12962 218 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MORC3Q14149 939 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 LLGL1Q15334 1064 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 IGSF22Q8N9C0 903 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF461Q8TAF7 563 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 FAM3CQ92520 227 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL5Q96PQ7 755 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ASB2Q96Q27 587 aa4.68□□□□□ -1.66
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