RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.66■■□□□ 1.22
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SOCS1-201ENST00000332029 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.66■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 HPS4Q9NQG7 708 aa22.66■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 L1RE1Q9UN81 338 aa22.66■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 HUS1O60921 280 aa22.65■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 KRT19P08727 400 aa22.65■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 CSH1P0DML2 217 aa22.65■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 CSH2P0DML3 217 aa22.65■■□□□ 1.22
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SOCS1-201ENST00000332029 TXNDC8Q6A555 127 aa22.65■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.65■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.65■■□□□ 1.22
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SOCS1-201ENST00000332029 SIX4Q9UIU6 781 aa22.65■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SOCS1-201ENST00000332029 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
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SOCS1-201ENST00000332029 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.21
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SOCS1-201ENST00000332029 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.64■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 SDHAF4Q5VUM1 108 aa22.64■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 PKN3Q6P5Z2 889 aa22.64■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.64■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.64■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.64■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 ACBD6Q9BR61 282 aa22.64■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.64■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 INTS13Q9NVM9 706 aa22.64■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.64■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
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SOCS1-201ENST00000332029 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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SOCS1-201ENST00000332029 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.63■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa22.63■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa22.63■■□□□ 1.21
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SOCS1-201ENST00000332029 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.63■■□□□ 1.21
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SOCS1-201ENST00000332029 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 UNC13DQ70J99 1090 aa22.62■■□□□ 1.21
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SOCS1-201ENST00000332029 CHFRQ96EP1 664 aa22.62■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
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SOCS1-201ENST00000332029 OSTM1Q86WC4 334 aa22.61■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.61■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.61■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 SPATA18Q8TC71 538 aa22.61■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 PKMYT1Q99640 499 aa22.61■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.61■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.61■■□□□ 1.21
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