RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317221.11

ZNF559-201, Transcript of zinc finger protein 559, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ZNF559, Length 2,732 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559-201ENST00000317221 ETS1P14921 441 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 RFX1P22670 979 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 SSTR1P30872 391 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 SERPINB6P35237 376 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 HOXD12P35452 270 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 GPX6P59796 221 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 DLG4P78352 724 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 ARHGAP4P98171 946 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 SLC25A3Q00325 362 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 PLCB3Q01970 1234 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 CETN1Q12798 172 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 TFDP1Q14186 410 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 CCDC142Q17RM4 750 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 USH1GQ495M9 461 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 EFHC1Q5JVL4 640 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 SLC15A3Q8IY34 581 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 HIPK4Q8NE63 616 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 NEDD1Q8NHV4 660 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 EPS8L1Q8TE68 723 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 USP6NLQ92738 828 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 BTBD9Q96Q07 612 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 SMYD3Q9H7B4 428 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 PPCSQ9HAB8 311 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 ZNF287Q9HBT7 754 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 KCNK4Q9NYG8 393 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 ZNF180Q9UJW8 692 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 PCDHGB4Q9UN71 923 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 POLIQ9UNA4 740 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 ZNF148Q9UQR1 794 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 DMTF1Q9Y222 760 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 ARAP2Q8WZ64 1704 aa6□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 KANSL1LA0AUZ9 987 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 CAPN8A6NHC0 703 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 USP17L15C9J2P7 530 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 USP17L13C9JLJ4 530 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 USP17L11C9JVI0 530 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 USP17L18D6R9N7 530 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 USP17L22D6RA61 530 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 USP17L17D6RBQ6 530 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 USP17L19D6RCP7 530 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 USP17L20D6RJB6 530 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 E5RJQ4 531 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 GOLGA8SH3BPF8 625 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 GOLGA8MH3BSY2 632 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 DENRO43583 198 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 BANF1O75531 89 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 MT-ND3P03897 115 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 DHRS4L1P0CG22 281 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 KITP10721 976 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 DPEP1P16444 411 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 YY1P25490 414 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 PMLP29590 882 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 CPOXP36551 454 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 FDFT1P37268 417 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 ARSEP51690 589 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 NCKAP1LP55160 1127 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 ARHGAP8P85298 464 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 FMO1Q01740 532 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 CYP4A11Q02928 519 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 BTKQ06187 659 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 USP17L24Q0WX57 530 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 BFSP1Q12934 665 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 GPS1Q13098 491 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 GRAMD1BQ3KR37 738 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 EFHC2Q5JST6 749 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 PAOXQ6QHF9 649 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 USP17L6PQ6QN14 398 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 CENPUQ71F23 418 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 ZNF410Q86VK4 478 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 SLF2Q8IX21 1173 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 SLFN12Q8IYM2 578 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 FAM71AQ8IYT1 594 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 RILPQ96NA2 401 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 CCDC106Q9BWC9 280 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 JMJD4Q9H9V9 463 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 OLFML3Q9NRN5 406 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 TBCCD1Q9NVR7 557 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 DMAC2Q9NW81 257 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 SOX13Q9UN79 622 aa5.99□□□□□ -1.45
ZNF559-201ENST00000317221 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms