RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GTF2H1P32780 548 aa23.77■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SHMT1P34896 483 aa23.77■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDK18Q07002 472 aa23.77■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CIAPIN1Q6FI81 312 aa23.77■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RCOR2Q8IZ40 523 aa23.77■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa23.77■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC106Q9BWC9 280 aa23.77■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PCDH9Q9HC56 1237 aa23.77■■□□□ 1.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A0A088AWK7 358 aa23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDK4P11802 303 aa23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRT5P13647 590 aa23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GJC1P36383 396 aa23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC18A2Q05940 514 aa23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC25A41Q8N5S1 370 aa23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WWP1Q9H0M0 922 aa23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PPME1Q9Y570 386 aa23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MYPNQ86TC9 1320 aa23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MMEL1Q495T6 779 aa23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EFHC1Q5JVL4 640 aa23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LIN9Q5TKA1 542 aa23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KAZNQ674X7 775 aa23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LLGL2Q6P1M3 1020 aa23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC30A10Q6XR72 485 aa23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANKRD23Q86SG2 305 aa23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FBXO11Q86XK2 927 aa23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPIRE2Q8WWL2 714 aa23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa23.75■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GOLGA8SH3BPF8 625 aa23.75■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GOLGA8MH3BSY2 632 aa23.75■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TFAP2AP05549 437 aa23.75■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRT10P13645 584 aa23.75■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CPOXP36551 454 aa23.75■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NSFP46459 744 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EMP3P54852 163 aa23.75■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VCPP55072 806 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADARP55265 1226 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LPCAT4Q643R3 524 aa23.75■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.75■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C7orf26Q96N11 449 aa23.75■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SETDB2Q96T68 719 aa23.75■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa23.75■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USTQ9Y2C2 406 aa23.75■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PEX1O43933 1283 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PGM3O95394 542 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADRB2P07550 413 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ABCD1P33897 745 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLCN2P51788 898 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MDH1BQ5I0G3 518 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KLHDC10Q6PID8 442 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C1orf228Q6PIY5 440 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SH2D5Q6ZV89 423 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARPINQ7Z6K5 226 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF554Q86TJ5 538 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF677Q86XU0 584 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GSTCDQ8NEC7 633 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM8AQ9HCN3 771 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RAB20Q9NX57 234 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF232Q9UNY5 417 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 I3L4J1 428 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HIC1Q14526 733 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OASLQ15646 514 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USH1GQ495M9 461 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MON1BQ7L1V2 547 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GDPD5Q8WTR4 605 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GAB3Q8WWW8 586 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PYDC1Q8WXC3 89 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLITRK1Q96PX8 696 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WDR18Q9BV38 432 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM165Q9HC07 324 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.74■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PIAS1O75925 651 aa23.73■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ITGAVP06756 1048 aa23.73■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TSHRP16473 764 aa23.73■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDE1BQ01064 536 aa23.73■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRRC36Q1X8D7 754 aa23.73■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLFN13Q68D06 897 aa23.73■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLAIN2Q9P270 581 aa23.73■■□□□ 1.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SOX13Q9UN79 622 aa23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms