RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 TFAP2BQ92481 460 aa29.42■■■□□ 2.3
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UBP1-201ENST00000283628 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 LHX5Q9H2C1 402 aa29.42■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa29.42■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 WFS1O76024 890 aa29.41■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 PSMA2P25787 234 aa29.41■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 STAT5BP51692 787 aa29.41■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 ATP11AP98196 1134 aa29.41■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 TAZQ16635 292 aa29.41■■■□□ 2.3
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UBP1-201ENST00000283628 SH3D19Q5HYK7 790 aa29.41■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 CYP4A22Q5TCH4 519 aa29.41■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 HHATQ5VTY9 493 aa29.41■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 BBS12Q6ZW61 710 aa29.41■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 THNSL1Q8IYQ7 743 aa29.41■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 LRRC37BQ96QE4 947 aa29.41■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 MYLK2Q9H1R3 596 aa29.41■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 ETNK1Q9HBU6 452 aa29.41■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 RABGEF1Q9UJ41 708 aa29.41■■■□□ 2.3
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UBP1-201ENST00000283628 GPX6P59796 221 aa29.41■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 PARP6Q2NL67 630 aa29.41■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 ZNF699Q32M78 642 aa29.41■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 SPDYAQ5MJ70 313 aa29.41■■■□□ 2.3
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UBP1-201ENST00000283628 LRMDAQ9H2I8 198 aa29.41■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 GRID1Q9ULK0 1009 aa29.41■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 STK38LQ9Y2H1 464 aa29.41■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 ASPAP45381 313 aa29.4■■■□□ 2.3
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UBP1-201ENST00000283628 CAPN12Q6ZSI9 719 aa29.4■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 ACTL9Q8TC94 416 aa29.4■■■□□ 2.3
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UBP1-201ENST00000283628 C15orf41Q9Y2V0 281 aa29.4■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 MED7O43513 233 aa29.4■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 DDNO94850 711 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
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UBP1-201ENST00000283628 WEE2P0C1S8 567 aa29.4■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 KRT3P12035 628 aa29.4■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
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UBP1-201ENST00000283628 NAT8LQ8N9F0 302 aa29.4■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 FAM167AQ96KS9 214 aa29.4■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 TRIM33Q9UPN9 1127 aa29.4■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa29.4■■■□□ 2.3
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UBP1-201ENST00000283628 E7ESA3 106 aa29.39■■■□□ 2.3
UBP1-201ENST00000283628 TSHRP16473 764 aa29.39■■■□□ 2.3
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UBP1-201ENST00000283628 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
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UBP1-201ENST00000283628 ZNF398Q8TD17 642 aa29.37■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 C10orf82Q8WW14 230 aa29.37■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
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