RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 HPS6Q86YV9 775 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 SLFN12Q8IYM2 578 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 RNF148Q8N7C7 305 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 COL18A1P39060 1754 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 VILLO15195 856 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PPP3CAQ08209 521 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 FAAP100Q0VG06 881 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 BST1Q10588 318 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 KRT72Q14CN4 511 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 LPCAT2Q7L5N7 544 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM110Q86TL2 294 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 AGR3Q8TD06 166 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 GAB3Q8WWW8 586 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 E2F7Q96AV8 911 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 VPS11Q9H270 941 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ARMC7Q9H6L4 198 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PCDH18Q9HCL0 1135 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PDGFRBP09619 1106 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 DLDP09622 509 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 RAP1GDS1P52306 607 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 MFAP3P55082 362 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 GK3PQ14409 553 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 C6orf52Q5T4I8 152 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 FBXL19Q6PCT2 694 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 C16orf87Q6PH81 154 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CD101Q93033 1021 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PI4K2AQ9BTU6 479 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CLEC11AQ9Y240 323 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ESYT2A0FGR8 921 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CYB561D2O14569 222 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 EDIL3O43854 480 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 POLR2MP0CAP2 368 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 BTDP43251 543 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ALDH1A3P47895 512 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 BMPR2Q13873 1038 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CCNG2Q16589 344 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TXNRD3Q86VQ6 643 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 RSAD2Q8WXG1 361 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PPP1R36Q96LQ0 422 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 EBF4Q9BQW3 602 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 JMJD4Q9H9V9 463 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CYLDQ9NQC7 956 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 RRN3Q9NYV6 651 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 SLC24A2Q9UI40 661 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TIAM2Q8IVF5 1701 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM49D1C9J1S8 452 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 KCNQ2O43526 872 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ABHD2P08910 425 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CYP11B1P15538 503 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 GLRA2P23416 452 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 RXRBP28702 533 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 FDFT1P37268 417 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 SLC1A1P43005 524 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ENTPD1P49961 510 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGAP4P98171 946 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 FMO1Q01740 532 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 LMNB2Q03252 620 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TLR1Q15399 786 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 KLHL38Q2WGJ6 581 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ERFEQ4G0M1 354 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 RINT1Q6NUQ1 792 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 SLF2Q8IX21 1173 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF34Q8IZ26 560 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CYP2W1Q8TAV3 490 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 WDR37Q9Y2I8 494 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGEF35A5YM69 484 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TM9SF1O15321 606 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 ATP9BO43861 1147 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TFAP2AP05549 437 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 HDAC4P56524 1084 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 CENPCQ03188 943 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 KRT80Q6KB66 452 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 C3orf67Q6ZVT6 689 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 NLRX1Q86UT6 975 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 RHOT1Q8IXI2 618 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PDIK1LQ8N165 341 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 DCUN1D1Q96GG9 259 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 BRD8Q9H0E9 1235 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 KCNK13Q9HB14 408 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 SPATA7Q9P0W8 599 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PCDHGB4Q9UN71 923 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 AP4B1Q9Y6B7 739 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRR-201ENST00000283228 DCCP43146 1447 aa11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms