RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 CAV1Q03135 178 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 BFSP1Q12934 665 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 RASA2Q15283 850 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 LY6KQ17RY6 165 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 FAM182AQ5T1J6 154 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 LCA5Q86VQ0 697 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 BBOF1Q8ND07 529 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 OSBPL8Q9BZF1 889 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 LRRC19Q9H756 370 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa11.35□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 ARHGEF35A5YM69 484 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 MEI4A8MW99 385 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 I3L4J1 428 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 ANPEPP15144 967 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 TRIP10Q15642 601 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 RABGAP1LQ5R372 815 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 BORCS6Q96GS4 357 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 TEX13BQ9BXU2 312 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 DCLK3Q9C098 648 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 SAR1AQ9NR31 198 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 KRT82Q9NSB4 513 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 SLC17A7Q9P2U7 560 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 VWA5AO00534 786 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 EDIL3O43854 480 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 LPXNO60711 386 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 NR3C2P08235 984 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 SATL1Q86VE3 508 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 SCUBE1Q8IWY4 988 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 PHF12Q96QT6 1004 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 MMP19Q99542 508 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 TUBB6Q9BUF5 446 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 KIFC3Q9BVG8 833 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 EBF3Q9H4W6 596 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 RIOX1Q9H6W3 641 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 ZWILCHQ9H900 591 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 EHMT1Q9H9B1 1298 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 TXNRD2Q9NNW7 524 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF212Q9UDV6 495 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 NOD1Q9Y239 953 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 SUPT3HO75486 399 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 VAV1P15498 845 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 MYBPC3Q14896 1274 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM63BQ5T3F8 832 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 LPCAT4Q643R3 524 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 FAM84AQ96KN4 292 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 ECSITQ9BQ95 431 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 NMUR2Q9GZQ4 415 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 A0A0C4DFX4 3053 aa11.34□□□□□ -0.59
CNGA3-201ENST00000272602 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 FAM86B1E9PN63 330 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 DNAJC6O75061 913 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 FAM86B2P0C5J1 330 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 SPATA31D3P0C874 917 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 CA8P35219 290 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 TMPRSS15P98073 1019 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 RINT1Q6NUQ1 792 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 FOXR2Q6PJQ5 311 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 C10orf88Q9H8K7 445 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 PDGFCQ9NRA1 345 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 TELO2Q9Y4R8 837 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 LRRIQ4A6NIV6 560 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 BTBD19C9JJ37 291 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 WDR46O15213 610 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 ELNP15502 786 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 RPA1P27694 616 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 VAMP7P51809 220 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 TATDN1Q6P1N9 297 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 CENPUQ71F23 418 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 USP6NLQ92738 828 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 GATA6Q92908 595 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 C11orf70Q9BRQ4 267 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 HERPUD2Q9BSE4 406 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 MIS12Q9H081 205 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 BTBD7Q9P203 1132 aa11.33□□□□□ -0.6
CNGA3-201ENST00000272602 TIAM2Q8IVF5 1701 aa11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms