RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 RTP1P59025 263 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 HGSNATQ68CP4 663 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 RXFP2Q8WXD0 754 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 ERP44Q9BS26 406 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 KCND1Q9NSA2 647 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 CRHR2Q13324 411 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 PID1Q7Z2X4 250 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 VSIG1Q86XK7 387 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 CREG2Q8IUH2 290 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 ZIM3Q96PE6 472 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 PCDHB18PQ96TA0 734 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 ADAM2Q99965 735 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 A6NNZ2 444 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 RASA4BC9J798 803 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 RASA4O43374 803 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 TUBB8Q3ZCM7 444 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 NPLOC4Q8TAT6 608 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 SLC2A14Q8TDB8 520 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 FBF1Q8TES7 1133 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 TTYH3Q9C0H2 523 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 COL24A1Q17RW2 1714 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 KPNA7A9QM74 516 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 ACADSBP45954 432 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 MARCKSL1P49006 195 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM63BQ5T3F8 832 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 PALB2Q86YC2 1186 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 C12orf29Q8N999 325 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 ACTRT1Q8TDG2 376 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 ISCUQ9H1K1 167 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa10.83□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 A0A0B4J269 797 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 APRTP07741 180 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 GARSP41250 739 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 ZACNQ401N2 412 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 LRRC31Q6UY01 552 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 CD99L2Q8TCZ2 262 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 NCAPGQ9BPX3 1015 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 C10orf88Q9H8K7 445 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 RAB6BQ9NRW1 208 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 USP18Q9UMW8 372 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 LY75O60449 1722 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 CD52P31358 61 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 PPM1NQ8N819 430 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 FSD1LQ9BXM9 530 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 CYP3A43Q9HB55 503 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 AOC2O75106 756 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 PRLRP16471 622 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 IL9RQ01113 521 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 MBTD1Q05BQ5 628 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 HIF1AQ16665 826 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 TAF2Q6P1X5 1199 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 FAM131BQ86XD5 332 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 ARRDC4Q8NCT1 418 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 ADAM32Q8TC27 787 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 PGLYRP2Q96PD5 576 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 TRAIPQ9BWF2 469 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 E5RJQ4 531 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 F8VP50 259 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 LSM8O95777 96 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 CAV1Q03135 178 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 ADIGQ0VDE8 80 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 EFHC1Q5JVL4 640 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 C11orf63Q6NUN7 778 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 EDEM1Q92611 657 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM121Q9BTD3 319 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM106CQ9BVX2 250 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 NEU2Q9Y3R4 380 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 CA4P22748 312 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 BCAT1P54687 386 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 GUCY1A3Q02108 690 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 SHC3Q92529 594 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 ECM29Q5VYK3 1845 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa10.82□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 ATP9BO43861 1147 aa10.81□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 IFT88Q13099 833 aa10.81□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 CCDC6Q16204 474 aa10.81□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa10.81□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 PDZD7Q9H5P4 517 aa10.81□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 DDIT4Q9NX09 232 aa10.81□□□□□ -0.68
TTPAL-201ENST00000262605 SALL4Q9UJQ4 1053 aa10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms