RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261407.8

LPCAT3-201, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LPCAT3, Length 2,268 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3-201ENST00000261407 FOXN2P32314 431 aa20.24■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.24■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 C2orf40Q9H1Z8 148 aa20.24■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 VPS37BQ9H9H4 285 aa20.24■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 ANK1P16157 1881 aa20.24■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 STX2P32856 288 aa20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 WDR4P57081 412 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 MSS51Q4VC12 460 aa20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF667Q5HYK9 610 aa20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 XYLT1Q86Y38 959 aa20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 OTOFQ9HC10 1997 aa20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 ITGAVP06756 1048 aa20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 STAG3L1P0CL83 205 aa20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 COPS2P61201 443 aa20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 SURF1Q15526 300 aa20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 CCDC142Q17RM4 750 aa20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 UBA3Q8TBC4 463 aa20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 SPOCK2Q92563 424 aa20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 MMP19Q99542 508 aa20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 CCDC77Q9BR77 488 aa20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 SYNCQ9H7C4 482 aa20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 SLC12A4Q9UP95 1085 aa20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 A0A087WZ62 844 aa20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 GHRP10912 638 aa20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.835e-7■□□□□ 11.3
LPCAT3-201ENST00000261407 SULF1Q8IWU6 871 aa20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 C4orf33Q8N1A6 199 aa20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 CXorf38Q8TB03 319 aa20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 CFAP57Q96MR6 1250 aa20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 BCO2Q9BYV7 579 aa20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 UBOX5O94941 541 aa20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 VTNP04004 478 aa20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 KDELR1P24390 212 aa20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 KCTD2Q14681 263 aa20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 FNBP1LQ5T0N5 605 aa20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 HSPH1Q92598 858 aa20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.22■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 A0A1W2PPM1 405 aa20.21■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 GAS2O43903 313 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 MICAL2O94851 1124 aa20.21■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 C22orf31O95567 290 aa20.21■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 INSRRP14616 1297 aa20.21■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 PTPN7P35236 360 aa20.21■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 GPX6P59796 221 aa20.21■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 TAP1Q03518 808 aa20.21■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 XRCC4Q13426 336 aa20.21■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 MORF4L2Q15014 288 aa20.21■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 FAM47EQ6ZV65 393 aa20.21■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 TRABD2AQ86V40 505 aa20.21■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 FAM228AQ86W67 206 aa20.21■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 UNC45BQ8IWX7 931 aa20.21■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.21■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 LHX5Q9H2C1 402 aa20.21■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.21■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 GRID1Q9ULK0 1009 aa20.21■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 STRIP2Q9ULQ0 834 aa20.21■□□□□ 0.83
LPCAT3-201ENST00000261407 ABHD2P08910 425 aa20.2■□□□□ 0.82
LPCAT3-201ENST00000261407 SSTR1P30872 391 aa20.2■□□□□ 0.82
LPCAT3-201ENST00000261407 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
LPCAT3-201ENST00000261407 MMRN1Q13201 1228 aa20.2■□□□□ 0.82
LPCAT3-201ENST00000261407 TFDP1Q14186 410 aa20.2■□□□□ 0.82
LPCAT3-201ENST00000261407 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.2■□□□□ 0.82
LPCAT3-201ENST00000261407 CPT1BQ92523 772 aa20.2■□□□□ 0.82
LPCAT3-201ENST00000261407 RMDN2Q96LZ7 410 aa20.2■□□□□ 0.82
LPCAT3-201ENST00000261407 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.2■□□□□ 0.82
LPCAT3-201ENST00000261407 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
LPCAT3-201ENST00000261407 ALOX15BO15296 676 aa20.2■□□□□ 0.82
LPCAT3-201ENST00000261407 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
LPCAT3-201ENST00000261407 TAC1P20366 129 aa20.2■□□□□ 0.82
LPCAT3-201ENST00000261407 MIPP30301 263 aa20.2■□□□□ 0.82
LPCAT3-201ENST00000261407 MGAT5Q09328 741 aa20.2■□□□□ 0.82
LPCAT3-201ENST00000261407 MOGSQ13724 837 aa20.2■□□□□ 0.82
LPCAT3-201ENST00000261407 AMHR2Q16671 573 aa20.2■□□□□ 0.82
LPCAT3-201ENST00000261407 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.2■□□□□ 0.82
LPCAT3-201ENST00000261407 P3H4Q92791 437 aa20.2■□□□□ 0.82
LPCAT3-201ENST00000261407 PEBP4Q96S96 227 aa20.2■□□□□ 0.82
LPCAT3-201ENST00000261407 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms