RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 SDHAF4Q5VUM1 108 aa22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 TXNDC8Q6A555 127 aa22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 MYRFLQ96LU7 910 aa22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 FAM83CQ9BQN1 747 aa22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 GMEB2Q9UKD1 530 aa22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 NOL4O94818 638 aa22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 HOXD13P35453 343 aa22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 RUNX3Q13761 415 aa22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 FAM171BQ6P995 826 aa22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 SHC4Q6S5L8 630 aa22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 WDR49Q8IV35 697 aa22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 SDHBP21912 280 aa22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 CNR2P34972 360 aa22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 CCINQ13939 588 aa22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 WDR44Q5JSH3 913 aa22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 DLL3Q9NYJ7 618 aa22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 CDH9Q9ULB4 789 aa22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 CCL26Q9Y258 94 aa22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 MAGEA11P43364 429 aa22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 Q6ZS52 159 aa22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 UNC13DQ70J99 1090 aa22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 LONP2Q86WA8 852 aa22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 FSIP1Q8NA03 581 aa22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 RDH13Q8NBN7 331 aa22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 STKLD1Q8NE28 680 aa22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 FNBP1Q96RU3 617 aa22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 SYT15Q9BQS2 421 aa22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 UBE4BO95155 1302 aa22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 PTPRJQ12913 1337 aa22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 TGFB1I1O43294 461 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 TNNI1P19237 187 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 LMO2P25791 158 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 FNTBP49356 437 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 ARHGAP8P85298 464 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 PDGFRLQ15198 375 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 LAIR1Q6GTX8 287 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 VSTM1Q6UX27 236 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 PRR23BQ6ZRT6 265 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 EXOC4Q96A65 974 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 MMS19Q96T76 1030 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 EBF3Q9H4W6 596 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 HPS4Q9NQG7 708 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 CEP250Q9BV73 2442 aa22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 K7ESF4 209 aa22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 HCRTO43612 131 aa22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 ATP2C2O75185 946 aa22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 FAM163BP0C2L3 166 aa22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 USP17L7P0C7H9 530 aa22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 WARSP23381 471 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 HOXA6P31267 233 aa22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 ATL3Q6DD88 541 aa22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 HSCBQ8IWL3 235 aa22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 OBSL1O75147 1896 aa22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 CLIC2O15247 247 aa22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms