RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 UBN1Q9NPG3 1134 aa10.09□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 GDF3Q9NR23 364 aa10.09□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP10.09□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM53CQ9NYF3 392 aa10.09□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 HMGXB4Q9UGU5 601 aa10.09□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 L1RE1Q9UN81 338 aa10.09□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP10.09□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A0U1RQF3 1178 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 SIGLEC16A6NMB1 481 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 MAP2K7O14733 419 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 INPPL1O15357 1258 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 SART1O43290 800 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 CTSHP09668 335 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 PYGMP11217 842 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 WARSP23381 471 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 GRK4P32298 578 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 RPL9P32969 192 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 PAK2Q13177 524 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 LPIN1Q14693 890 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 CYP1B1Q16678 543 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 PTPROQ16827 1216 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 SOWAHAQ2M3V2 549 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 PKDCCQ504Y2 493 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 TRAF7Q6Q0C0 670 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 MAATS1Q7Z4T9 603 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 RHOT1Q8IXI2 618 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 KATNAL2Q8IYT4 538 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 GSTCDQ8NEC7 633 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC26Q8TAB7 109 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 SPATA18Q8TC71 538 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 MAIP1Q8WWC4 291 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 PGBD4Q96DM1 585 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 C18orf8Q96DM3 657 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 MCRS1Q96EZ8 462 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 KRT12Q99456 494 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 FUT8Q9BYC5 575 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 TRIM7Q9C029 511 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 KLK14Q9P0G3 267 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 PADI3Q9ULW8 664 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 PHF24Q9UPV7 400 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 NOD1Q9Y239 953 aa10.08□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 MGAMO43451 1857 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM170AA1A519 330 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 M0QYV0 167 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 FSCN2O14926 492 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 SPTLC1O15269 473 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 THP07101 528 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 GHRP10912 638 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 CD52P31358 61 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 MARCKSL1P49006 195 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 SNX16P57768 344 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 LILRA4P59901 499 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 PDCLQ13371 301 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 ACAP1Q15027 740 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 C2CD6Q53TS8 623 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 LLGL2Q6P1M3 1020 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 DCUN1D2Q6PH85 259 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 AGMOQ6ZNB7 445 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 XYLT1Q86Y38 959 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 APPL2Q8NEU8 664 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 HDAC7Q8WUI4 952 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 SEC14L1Q92503 715 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 CYLDQ9NQC7 956 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 OGFRQ9NZT2 677 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 CYTH4Q9UIA0 394 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 TSPAN16Q9UKR8 245 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 MTUS1Q9ULD2 1270 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 NME7Q9Y5B8 376 aa10.07□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 KAT6AQ92794 2004 aa10.06□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1W2PQY0 241 aa10.06□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM187AA6NFU0 413 aa10.06□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 A8MXQ7 604 aa10.06□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 ARVCFO00192 962 aa10.06□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 GABRDO14764 452 aa10.06□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 RAD51CO43502 376 aa10.06□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 HUS1O60921 280 aa10.06□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 PHF2O75151 1096 aa10.06□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 GLI1P08151 1106 aa10.06□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 PFKMP08237 780 aa10.06□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 KRT3P12035 628 aa10.06□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 CHRNA3P32297 505 aa10.06□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 SCNN1AP37088 669 aa10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms