RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 ASGR1P07306 291 aa25.25■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 CYP3A5P20815 502 aa25.25■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 TAF6P49848 677 aa25.25■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 SP3Q02447 781 aa25.25■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 MTMR3Q13615 1198 aa25.25■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 SOWAHAQ2M3V2 549 aa25.25■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa25.25■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 IQCKQ8N0W5 287 aa25.25■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 ATG4AQ8WYN0 398 aa25.25■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 MCRS1Q96EZ8 462 aa25.25■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 HERPUD2Q9BSE4 406 aa25.25■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 CHST7Q9NS84 486 aa25.25■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 PI4K2BG5E9Z4 385 aa25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 AOC2O75106 756 aa25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 PLTPP55058 493 aa25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 NKX3-2P78367 333 aa25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 HADHQ16836 314 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 SV2CQ496J9 727 aa25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 SERINC5Q86VE9 423 aa25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 HACE1Q8IYU2 909 aa25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 SLCO2A1Q92959 643 aa25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 SLITRK1Q96PX8 696 aa25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 DCLK3Q9C098 648 aa25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM49BQ9NUQ9 324 aa25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 ADAM21Q9UKJ8 722 aa25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 GOLGA8KD6RF30 607 aa25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 KIF3CO14782 793 aa25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 COPS2P61201 443 aa25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 EMC1Q8N766 993 aa25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC114Q96M63 670 aa25.24■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 GAS8O95995 478 aa25.23■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 ELNP15502 786 aa25.23■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 HSD17B3P37058 310 aa25.23■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 RPL21P46778 160 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 KRT17Q04695 432 aa25.23■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 KCNA10Q16322 511 aa25.23■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 OR6B2Q6IFH4 312 aa25.23■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 POLNQ7Z5Q5 900 aa25.23■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 ARRDC4Q8NCT1 418 aa25.23■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 APPL2Q8NEU8 664 aa25.23■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 SH3GL2Q99962 352 aa25.23■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 SNX25Q9H3E2 840 aa25.23■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa25.23■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 GDAP2Q9NXN4 497 aa25.23■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 CENPFP49454 3210 aa25.23■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 TJP3O95049 919 aa25.22■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 FLT3P36888 993 aa25.22■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 KAZNQ674X7 775 aa25.22■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 TMC3Q7Z5M5 1100 aa25.22■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM204AQ9H8W3 233 aa25.22■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa25.22■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 E5RJQ4 531 aa25.22■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 HUS1O60921 280 aa25.22■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 RNF8O76064 485 aa25.22■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 KRT7P08729 469 aa25.22■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 SNX16P57768 344 aa25.22■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 CCNG2Q16589 344 aa25.22■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 MFSD7Q6UXD7 560 aa25.22■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 ATL2Q8NHH9 583 aa25.22■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 CHST12Q9NRB3 414 aa25.22■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 PLAAQ9Y263 795 aa25.22■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRD1A4D1F6 860 aa25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 PIK3R2O00459 728 aa25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 LRCH4O75427 683 aa25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 SETSIPP0DME0 302 aa25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 CALCOCO2Q13137 446 aa25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 PIK3R5Q8WYR1 880 aa25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 WNT8BQ93098 351 aa25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM105AQ9NUU6 356 aa25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 RNF186Q9NXI6 227 aa25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 GRHL1Q9NZI5 618 aa25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 GOLGA6CA6NDK9 693 aa25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 CHRNA1P02708 482 aa25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 PFKMP08237 780 aa25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 GOLGA6DP0CG33 693 aa25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 RGS7P49802 495 aa25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 ACAP1Q15027 740 aa25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 FBXO25Q8TCJ0 367 aa25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 ZWILCHQ9H900 591 aa25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 ASNSD1Q9NWL6 643 aa25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa25.21■■□□□ 1.63
RPUSD1-201ENST00000007264 ASIC3Q9UHC3 531 aa25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms