RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006015.3

HOXA11-201, Transcript of homeobox A11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA11, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-201ENST00000006015 ARMC3Q5W041 872 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXA11-201ENST00000006015 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXA11-201ENST00000006015 LRRC6Q86X45 466 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXA11-201ENST00000006015 TMPRSS6Q8IU80 811 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXA11-201ENST00000006015 ALLCQ8N6M5 410 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXA11-201ENST00000006015 GLIS1Q8NBF1 620 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXA11-201ENST00000006015 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXA11-201ENST00000006015 ADAM33Q9BZ11 813 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXA11-201ENST00000006015 MIS12Q9H081 205 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXA11-201ENST00000006015 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXA11-201ENST00000006015 FZD1Q9UP38 647 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXA11-201ENST00000006015 IL1BP01584 269 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 SPP2Q13103 211 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 KRT39Q6A163 491 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ADGRD1Q6QNK2 874 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 PADI6Q6TGC4 694 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 SLC17A7Q9P2U7 560 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 RABGEF1Q9UJ41 708 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 POLIQ9UNA4 740 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 TAS2R40P59535 323 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 KLHL38Q2WGJ6 581 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 NME8Q8N427 588 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 MZB1Q8WU39 189 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 TEPSINQ96N21 525 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 DHRS4Q9BTZ2 278 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 GPAMQ9HCL2 828 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 DNPEPQ9ULA0 475 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 COQ4Q9Y3A0 265 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ADRB2P07550 413 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 KRT5P13647 590 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 CD58P19256 250 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 GPX6P59796 221 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 CDC16Q13042 620 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 TKFCQ3LXA3 575 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ACAD11Q709F0 780 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 SCUBE1Q8IWY4 988 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 KLHL23Q8NBE8 558 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 WNK4Q96J92 1243 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 PAFAH2Q99487 392 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 B2RBV5 119 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ARL4CP56559 192 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 MAP3K10Q02779 954 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 CIAPIN1Q6FI81 312 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 TTC7BQ86TV6 843 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 RIT2Q99578 217 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 OCEL1Q9H607 264 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 DHRS4L1P0CG22 281 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 MYL2P10916 166 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ACTR3P61158 418 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 NOP14P78316 857 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 HIF1AQ16665 826 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 TMEM8AQ9HCN3 771 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 CLUHO75153 1309 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 H3BRJ5 948 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 TM7SF2O76062 418 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 GLRA2P23416 452 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 GJC1P36383 396 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 NSFP46459 744 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 RPS6P62753 249 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 MTMR2Q13614 643 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 DNAL1Q4LDG9 190 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 RFX8Q6ZV50 586 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF677Q86XU0 584 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ANKMY2Q8IV38 441 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 PANX3Q96QZ0 392 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 NMUR2Q9GZQ4 415 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ACSS3Q9H6R3 686 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 MTMR1Q13613 665 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 TFDP1Q14186 410 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 UGCGQ16739 394 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 LIN9Q5TKA1 542 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 NAT14Q8WUY8 206 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 CPA5Q8WXQ8 436 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms