RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000035667.8

Trim62-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trim62, Length 3,752 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim62-201ENSMUST00000035667 Krt32Q62168 407 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Ccdc117Q6PB51 277 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Olfr297Q7TS07 310 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Armc6Q8BNU0 468 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Dcun1d2Q8BZJ7 259 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Smap1Q91VZ6 440 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Trex1Q91XB0 314 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Dpp3Q99KK7 738 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Haus8Q99L00 373 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Q9D2Q3 444 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Tmem206Q9D771 350 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Fam171a2A2A699 822 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 PtgisO35074 501 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Cyp2j11Q3UNV2 504 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Tmcc1Q69ZZ6 649 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Gbp5Q8CFB4 590 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Abcg8Q9DBM0 673 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Vmn2r63E9Q0K5 859 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Gm9268E9Q0M3 861 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Vmn2r62K7N712 859 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Adam15O88839 864 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Cd68P31996 326 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Scarf2P59222 833 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Psmc1P62192 440 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Mif4gdQ3UBZ5 222 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Smcr8Q3UMB5 935 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 MyrfQ3UR85 1138 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 SnrpaQ62189 287 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Arhgap10Q6Y5D8 786 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Gpr139Q80UC8 345 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Fam181bQ80VF6 417 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Scfd1Q8BRF7 639 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Rilpl2Q99LE1 197 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Sun1Q9D666 913 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 PrccQ9EQC8 491 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 C1qtnf1Q9QXP7 281 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Ror1Q9Z139 937 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Chek2Q9Z265 546 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Ank1Q02357 1862 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Clrn2B2RVW2 232 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Ace3D0G895 737 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Serpina1aP07758 413 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Fermt1P59113 677 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Plk1Q07832 603 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Kcnc2Q14B80 642 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Stip1Q60864 543 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Styk1Q6J9G1 429 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Scube1Q6NZL8 1018 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Vmn2r43Q80Z08 845 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Slc17a6Q8BLE7 582 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Trmt13Q8BYH3 481 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Depdc1aQ8CIG0 804 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Defb15Q8R2I5 79 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Zcchc12Q9CZA5 402 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Batf3Q9D275 118 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Krt16Q9Z2K1 469 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Smok3aC0HKC8 504 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Smok3bC0HKC9 504 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Lilra5D3Z7A9 295 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 DcxO88809 366 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Fgfr1P16092 822 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 VcpQ01853 806 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Cdk7Q03147 346 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Phactr1Q2M3X8 580 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Q3TQQ9 903 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Gm13103Q4VAD2 491 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Mea1Q64327 174 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Pla2g4cQ64GA5 597 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Galnt5Q8C102 930 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Pcdhb12Q91Y07 789 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Q9CR55 154 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 NkapQ9D0F4 415 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 EvplQ9D952 2035 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Topaz1E5FYH1 1653 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Zscan4-ps1A0A1C7CYV3 506 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Zscan4dA7KBS4 506 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 StrnO55106 780 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Npy5rO70342 466 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Pknox1O70477 436 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 RarbP22605 482 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Rad54lP70270 747 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Eps8Q08509 821 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Ogfod1Q3U0K8 545 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Zscan4fQ3URS2 506 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Grm6Q5NCH9 871 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Scnn1aQ61180 699 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Dpysl3Q62188 570 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Zscan4cQ80VJ6 506 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Slc17a8Q8BFU8 601 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Slc25a3Q8VEM8 357 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Hdhd5Q91WM2 419 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Oma1Q9D8H7 521 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Borcs5Q9D920 195 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Nrf1Q9WU00 503 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Peak1Q69Z38 1735 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Gm44511A0A0N4SW10 223 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Spata31d1dE9Q5W2 1247 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Gm8257E9Q8R3 264 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim62-201ENSMUST00000035667 Ptar1E9QAB6 424 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.5 ms