RNA–Protein interactions for RNA: YOR011W

AUS1, Transcript of Plasma membrane sterol transporter of the ATP-binding cassette family, yeast

Gene AUS1, Length 4,185 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AUS1	YOR011W	YER134C	P40081	178 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	YFR045W	P43617	309 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	LDB16	P25587	256 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	PSD1	P39006	500 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	PRY1	P47032	299 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	DAD4	P69851	72 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	HTB2	P02294	131 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	YFL068W	P0CX99	160 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	MRS3	P10566	314 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	CIN5	P40917	295 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	PIR5	P46999	287 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	DPP1	Q05521	289 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	USV1	Q12132	391 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	FLO9	P39712	1322 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	SAL1	D6W196	494 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	PAI3	P01094	68 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	QRI5	P32344	111 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	GON7	P46984	123 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	JID1	Q12350	301 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AUS1	YOR011W	SPC29	P33419	253 aa		2.78	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	GPI18	P38211	433 aa		2.78	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	POP7	P38291	140 aa		2.78	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	YGR017W	P53210	297 aa		2.78	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	FIT2	Q08906	153 aa		2.78	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	TIR1	P10863	254 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	YAR068W	P39564	161 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	CAB4	P53332	305 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	DIA1	P54005	336 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	CPT1	P17898	393 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	SRP21	P32342	167 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.77	□□□□□ -1.97	not detected
AUS1	YOR011W	YFL054C	P43549	646 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	IZH1	Q03419	316 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	MOH1	P38191	138 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	YGL230C	P53074	147 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	RAV2	Q03956	351 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	YDR114C	Q04597	100 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	YKL102C	P34249	101 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	UME6	P39001	836 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	ELC1	Q03071	99 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	RRG8	Q06109	277 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	CCH1	P50077	2039 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	RPL12B	P0CX54	165 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	YOX1	P34161	385 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	YKL069W	P36088	180 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	PRY2	P36110	329 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	BDH1	P39714	382 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	LST8	P41318	303 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	YGR045C	P53229	120 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	SCS22	Q6Q595	175 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	RPL39	P04650	51 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	UTR5	P32630	166 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	YPS1	P32329	569 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	IES6	P32617	166 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	YER188W	P40103	239 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	YDL218W	Q07629	317 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	MET32	Q12041	191 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	YCR023C	P25351	611 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	DUT1	P33317	147 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	UTH1	P36135	365 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	YHR140W	P38842	239 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	MST28	P39552	234 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	NCA3	P46955	337 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	ATG39	Q06159	398 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	SPO24	Q3E752	67 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	SRP14	P38985	146 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	YPI1	P43587	155 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	TOM7	P53507	60 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	HST4	P53688	370 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	YDL157C	Q12082	118 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	YDR215C	Q12240	137 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AUS1	YOR011W	SLO1	Q3E784	85 aa		2.75	□□□□□ -1.97

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.2 ms