RNA–Protein interactions for RNA: YKR065C

PAM17, Transcript of Constituent of the TIM23 complex, yeast

Gene PAM17, Length 594 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM17	YKR065C	YGR018C	P53211	109 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PAM17	YKR065C	ADD37	Q03233	198 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PAM17	YKR065C	LDS2	Q08218	356 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PAM17	YKR065C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PAM17	YKR065C	VMA16	P23968	213 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PAM17	YKR065C	CDC50	P25656	391 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PAM17	YKR065C	RIB5	P38145	238 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PAM17	YKR065C	ICS2	P38284	255 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PAM17	YKR065C	SNN1	P48232	102 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PAM17	YKR065C	PAU4	P53427	120 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PAM17	YKR065C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PAM17	YKR065C	YHP1	Q04116	353 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PAM17	YKR065C	TIM18	Q08749	192 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PAM17	YKR065C	YOR015W	Q12169	119 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PAM17	YKR065C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	YBR144C	P34215	104 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	SFT2	P38166	215 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	RPA43	P46669	326 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	HST4	P53688	370 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	UBC7	Q02159	165 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	AVO2	Q04749	426 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	RRG8	Q06109	277 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	CTR3	Q06686	241 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	PAU1	P0CE88	120 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	PAU14	P0CE89	120 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	PAU6	P0CE90	120 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	PAU18	P0CE91	120 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	PAU8	P0CE92	120 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	PAU11	P0CE93	120 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	UTR5	P32630	166 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	PAU13	P38725	120 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	SNF11	P38956	169 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	PET100	P38958	111 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	PAU10	Q03050	120 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	MRX11	Q03079	207 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	YMR007W	Q03675	126 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	PAU20	Q08322	120 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	PAU9	Q3E770	120 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	DDI2	P0CH63	225 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	DDI3	P0CH64	225 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	IRC23	Q08416	157 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	SEC59	P20048	519 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	HMX1	P32339	317 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	RPR2	P40571	144 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	FIP1	P45976	327 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	YPL162C	Q12042	273 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	ATP14	Q12349	124 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	YHR213W	P0CI67	198 aa		5.6	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	5.6	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	ELO2	P25358	347 aa		5.6	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	CYB5	P40312	120 aa		5.6	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	5.6	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	OCA2	P53949	197 aa		5.6	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	AYT1	Q12226	474 aa		5.6	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	TIR2	P33890	251 aa		5.59	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	MPC2	P38857	129 aa		5.59	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	POG1	P40473	351 aa		5.59	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	5.59	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	MCM22	P47167	239 aa		5.59	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	PCC1	Q3E833	88 aa		5.59	□□□□□ -1.51
PAM17	YKR065C	MRS1	P07266	363 aa		5.58	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	AGA1	P32323	725 aa		5.58	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	CMC1	P36064	111 aa		5.58	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	YHR173C	P38864	112 aa		5.58	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	IMP2	P46972	177 aa		5.58	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	FYV6	P53913	173 aa		5.58	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		5.58	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		5.58	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	5.57	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	AGE2	P40529	298 aa		5.57	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	GPI2	P46961	280 aa		5.57	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	DSK2	P48510	373 aa		5.57	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	YMR181C	Q03231	154 aa		5.57	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	ATG39	Q06159	398 aa		5.57	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	LOA1	Q06508	300 aa		5.57	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	FIT2	Q08906	153 aa		5.57	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	YPR063C	Q12160	140 aa		5.57	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	HTB2	P02294	131 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	MIG1	P27705	504 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	SDH4	P37298	181 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	TRS20	P38334	175 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	PHS1	P40857	217 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	ALG13	P53178	202 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	AIM24	P47127	394 aa		5.55	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	TDA4	P47153	279 aa		5.55	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	ERV2	Q12284	196 aa		5.55	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	MRPL4	P36517	319 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	HSP10	P38910	106 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PAM17	YKR065C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 76.8 ms