RNA–Protein interactions for RNA: YAL058W

CNE1, Transcript of Calnexin, yeast

Gene CNE1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CNE1	YAL058W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YAR068W	P39564	161 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YER188W	P40103	239 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	TRI1	Q05024	226 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	CSM4	Q08955	156 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	HAP3	P13434	144 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YBR220C	P38318	560 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YHR173C	P38864	112 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	SAS2	P40963	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YFL051C	P43552	160 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YFL015C	P43578	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	TDA4	P47153	279 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YGR151C	P53287	111 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	TOM7	P53507	60 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	PAU23	Q07987	124 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	FIT2	Q08906	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	PAU17	Q12370	124 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	UTR5	P32630	166 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	PMU1	P36069	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	PIR5	P46999	287 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	SDS23	P53172	527 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	ATP19	P81451	68 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	TVP18	Q04767	167 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	ADE8	P04161	214 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	ZRT1	P32804	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	FZF1	P32805	299 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YFL054C	P43549	646 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YNR071C	P53757	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	TIM10	P87108	93 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	CWC27	Q02770	301 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	GAT3	Q07928	141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	RPL39	P04650	51 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	TIR1	P10863	254 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YDL183C	P48569	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YGL230C	P53074	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YGR018C	P53211	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	COX18	P53239	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	GIM5	Q04493	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	CNL1	Q06333	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	NDE2	Q07500	545 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	RKI1	Q12189	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	SEC11	P15367	167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YCR022C	P25620	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	ICS2	P38284	255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	BDH1	P39714	382 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	HAC1	P41546	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YJL118W	P47022	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	BNA2	P47125	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	BRP1	P53194	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	MSC3	Q05812	728 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	FPR2	P32472	135 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	ELF1	P36053	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNE1	YAL058W	COX2	P00410	251 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	CSH1	P38287	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	DOG2	P38773	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	YGL118C	P53132	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	CRZ1	P53968	678 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	YDR366C	P87287	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	UPS3	Q04006	179 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	ATG33	Q06485	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	BPH1	P25356	2167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	ERS1	P17261	260 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	SFT2	P38166	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	YBL071C	P38185	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	LST8	P41318	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CNE1	YAL058W	ATP10	P18496	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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