RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640634.1

SCARB2-222, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5

Gene SCARB2, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-222	ENST00000640634	GABRD	O14764	452 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	SEC24A	O95486	1093 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	ADH1A	P07327	375 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF445	P59923	1031 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	LILRA6	Q6PI73	481 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	EFHB	Q8N7U6	833 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	SIX2	Q9NPC8	291 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	STK39	Q9UEW8	545 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	BECN2	A8MW95	431 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634		H7C4K7	107 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	GLUD1	P00367	558 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	C7	P10643	843 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	KCNA5	P22460	613 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	KCNMA1	Q12791	1236 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	ADAM15	Q13444	863 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	RAB33A	Q14088	237 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	COL19A1	Q14993	1142 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF394	Q53GI3	561 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	METTL23	Q86XA0	190 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	WHAMM	Q8TF30	809 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	PKMYT1	Q99640	499 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	DSE	Q9UL01	958 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	MTMR11	A4FU01	709 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	EPHB6	O15197	1021 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	TEX33	O43247	280 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	TACC1	O75410	805 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	PON1	P27169	355 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	NDST1	P52848	882 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	ADCY1	Q08828	1119 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	CUL2	Q13617	745 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	TAF4B	Q92750	862 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	SYT15	Q9BQS2	421 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	OR6C75	A6NL08	312 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	SMTNL1	A8MU46	457 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634		A8MXQ7	604 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	PMM2	O15305	246 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	ABLIM3	O94929	683 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	GPR15	P49685	360 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	CACNA2D1	P54289	1103 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	WDR44	Q5JSH3	913 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	PDXDC1	Q6P996	788 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	ACOT1	Q86TX2	421 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	GPR65	Q8IYL9	337 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	UBR7	Q8N806	425 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	C12orf29	Q8N999	325 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	NT5C1B	Q96P26	610 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	SNX25	Q9H3E2	840 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	CISH	Q9NSE2	258 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	LGALS16	A8MUM7	142 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	CLDN5	O00501	218 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	P4HA2	O15460	535 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	CILP	O75339	1184 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	C8A	P07357	584 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	CCDC130	P13994	396 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	PAX3	P23760	479 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SCARB2-222	ENST00000640634	CREM	Q03060	361 aa		11.66	□□□□□ -0.54

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