RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620854.4

NEDD9-216, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NEDD9, Length 4,086 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9-216ENST00000620854 FBXO28Q9NVF7 368 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 TAS2R1Q9NYW7 299 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 PRR12Q9ULL5 1215 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 IRS2Q9Y4H2 1338 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 DLEC1Q9Y238 1755 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 WDR46O15213 610 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 PSMD10O75832 226 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 INHBAP08476 426 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 BGNP21810 368 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 BASP1P80723 227 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 KRT81Q14533 505 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 KRT39Q6A163 491 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 TMEM270Q6UE05 265 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 SV2AQ7L0J3 742 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 EFCAB3Q8N7B9 438 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 LRRN4Q8WUT4 740 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 ATP6V0A1Q93050 837 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 ACCSQ96QU6 501 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 CALN1Q9BXU9 219 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 MANSC1Q9H8J5 431 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 MROH7Q68CQ1 1323 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 MAP3K7O43318 606 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 MYL2P10916 166 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 CNGA1P29973 690 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 CCND2P30279 289 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 PHBP35232 272 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 RPS6KA3P51812 740 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 OSTNP61366 133 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 ACVR2BQ13705 512 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 SEZ6Q53EL9 994 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 MFSD7Q6UXD7 560 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 EEPD1Q7L9B9 569 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 MCOLN2Q8IZK6 566 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 FBXL13Q8NEE6 735 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 GSDMBQ8TAX9 411 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 USP6NLQ92738 828 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 BTBD10Q9BSF8 475 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 MECRQ9BV79 373 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 TSSK1BQ9BXA7 367 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 PAPPAQ13219 1627 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 PIK3CDO00329 1044 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 IRF6O14896 467 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 RNF8O76064 485 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 MAP3K6O95382 1288 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 KRT1P04264 644 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 TMEM191BP0C7N4 346 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 SERPINB6P35237 376 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 LDHDQ86WU2 507 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 KBTBD2Q8IY47 623 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 ACER1Q8TDN7 264 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 SHC3Q92529 594 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 INPP5DQ92835 1189 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 ATP2A3Q93084 1043 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 MKL1Q969V6 931 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 NSL1Q96IY1 281 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 EPAS1Q99814 870 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 ZWILCHQ9H900 591 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 ELP3Q9H9T3 547 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 SEPT10Q9P0V9 454 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 C19orf81C9J6K1 198 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 F8VP50 259 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 STAM2O75886 525 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 PSMG1O95456 288 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 GSTT1P30711 240 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 DSG3P32926 999 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 NOVP48745 357 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 ACOT2P49753 483 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 HADHQ16836 314 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 IZUMO2Q6UXV1 221 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 SHKBP1Q8TBC3 707 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 HELQQ8TDG4 1101 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 DENND1AQ8TEH3 1009 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 CRYGNQ8WXF5 182 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 CEP170P1Q96L14 293 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 MBOAT7Q96N66 472 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 NMUR2Q9GZQ4 415 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 SMYD2Q9NRG4 433 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-216ENST00000620854 CHMP2BQ9UQN3 213 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms