RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 K7ESF4 209 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 F11P03951 625 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 FNTBP49356 437 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 NLRP12P59046 1061 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 ALCAMQ13740 583 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCINQ13939 588 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 SDHAF4Q5VUM1 108 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRR23BQ6ZRT6 265 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 PANK4Q9NVE7 773 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 RAB23Q9ULC3 237 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCL26Q9Y258 94 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 EXTL3O43909 919 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 HUS1O60921 280 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 AVPR1AP37288 418 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 LMNB2Q03252 620 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 BFSP1Q12934 665 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC39A14Q15043 492 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 LAIR1Q6GTX8 287 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 OSTM1Q86WC4 334 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 ACBD6Q9BR61 282 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 MTMR6Q9Y217 621 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 HRO43593 1189 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 KRT19P08727 400 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 CSH1P0DML2 217 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 CSH2P0DML3 217 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.171e-33■■■□□ 17.3
TRAPPC3-208ENST00000616074 HOXC13P31276 330 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCDC142Q17RM4 750 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 TXNDC8Q6A555 127 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 PDILTQ8N807 584 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 PKMYT1Q99640 499 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM83CQ9BQN1 747 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 HPS4Q9NQG7 708 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 GKN1Q9NS71 199 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 SIX4Q9UIU6 781 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 NCOR2Q9Y618 2525 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 HCRTO43612 131 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 TADA3O75528 432 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 CYP2F1P24903 491 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 ARHGAP8P85298 464 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 MYL7Q01449 175 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPEM2Q0P670 501 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 DDR2Q16832 855 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 LONP2Q86WA8 852 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 GPD1LQ8N335 351 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 SYNPOQ8N3V7 929 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 RIN3Q8TB24 985 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 CHFRQ96EP1 664 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM206Q9H813 350 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 RBP5P82980 135 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 RUNX3Q13761 415 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 EBF3Q9H4W6 596 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 ABCB6Q9NP58 842 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 TDP1Q9NUW8 608 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 GREB1Q4ZG55 1949 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 PTPRJQ12913 1337 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa22.3■■□□□ 1.16
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