RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614059.4

RPS6KC1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 DTNAQ9Y4J8 743 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 ANGPT2O15123 496 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 GLRBP48167 497 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 CACNA2D1P54289 1103 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 PPP4CP60510 307 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 EMC2Q15006 297 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 FRA10AC1Q70Z53 315 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 RIT2Q99578 217 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 RSAD1Q9HA92 442 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 WHRNQ9P202 907 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 E9PBE3 544 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 KLHL41O60662 606 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 PCSK7Q16549 785 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 SZRD1Q7Z422 152 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 SP8Q8IXZ3 490 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 TCP10LQ8TDR4 215 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 CCDC134Q9H6E4 229 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 AGLP35573 1532 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 GZMAP12544 262 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 XPAP23025 273 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 MARCKSL1P49006 195 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 CLEC4FQ8N1N0 589 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 EGFL8Q99944 293 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 FBXO40Q9UH90 709 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 PNMA3Q9UL41 463 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 KLRC4O43908 158 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 ADRA1DP25100 572 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 PTPN4P29074 926 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 ARHGDIAP52565 204 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 TPI1P60174 286 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 DSG1Q02413 1049 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 CUL2Q13617 745 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 IMPG1Q17R60 797 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 DCAF6Q58WW2 860 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 CNPY4Q8N129 248 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 PTPRN2Q92932 1015 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 IFT43Q96FT9 208 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 C3P01024 1663 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 TNFAIP2Q03169 654 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 IL17AQ16552 155 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 CBWD6Q4V339 395 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 CBWD3Q5JTY5 395 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 MIIPQ5JXC2 388 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 CBWD5Q5RIA9 395 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 MTHFD1LQ6UB35 978 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 FAM136AQ96C01 138 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 KCND2Q9NZV8 630 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 P4HA2O15460 535 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 SNX3O60493 162 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLURP2P0DP57 97 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 RFC5P40937 340 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 NPTX2P47972 431 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 EFNA5P52803 228 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 AMHR2Q16671 573 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 PEAK1Q9H792 1746 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 O00370 1275 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 PJA2O43164 708 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 RUBCNLQ9H714 662 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 PXDNQ92626 1479 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-208ENST00000614059 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms