RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 NUP93Q8N1F7 819 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 SH2D3CQ8N5H7 860 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 MS4A14Q96JA4 679 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 SPATA2Q9UM82 520 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 NRKQ7Z2Y5 1582 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL18O94889 574 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 SLC10A4Q96EP9 437 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 WHRNQ9P202 907 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 BTBD3Q9Y2F9 522 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 RAD54BQ9Y620 910 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 CLDN3O15551 220 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 EXTL3O43909 919 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 ATP6V1B1P15313 513 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 STILQ15468 1287 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC24Q50LG9 513 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 SETD9Q8NE22 299 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 SENP7Q9BQF6 1050 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 CD248Q9HCU0 757 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 METTL21EPA6NDL7 271 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 CYBBP04839 570 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 PIGSQ96S52 555 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM49BA6NDI0 452 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 FKBP6O75344 327 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 DDR2Q16832 855 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 DGKHQ86XP1 1220 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 BSNDQ8WZ55 320 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 FKBP9O95302 570 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 HOXD10P28358 340 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 ITGA9Q13797 1035 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 FKBP9P1Q75LS8 142 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 HAUS6Q7Z4H7 955 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 PIGOQ8TEQ8 1089 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 C1orf54Q8WWF1 131 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 BDH2Q9BUT1 245 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 AIM2O14862 343 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 MZT2AQ6P582 158 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 STKLD1Q8NE28 680 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 ERP44Q9BS26 406 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 UNC45AQ9H3U1 944 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PRG6 482 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 TRAPPC3O43617 180 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 TARSP26639 723 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 PGBD4Q96DM1 585 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 AGPAT1Q99943 283 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 BHMT2Q9H2M3 363 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 YWHABP31946 246 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 UBE3AQ05086 875 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 SCRN3Q0VDG4 424 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 ZFP1Q6P2D0 407 aa7.24□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 KCND2Q9NZV8 630 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 MED14O60244 1454 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 PHKA2P46019 1235 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 GPC3P51654 580 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 FAM83EQ2M2I3 478 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 HPS3Q969F9 1004 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
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