RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 GANQ9H2C0 597 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 ZNRF3Q9ULT6 936 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 SATB2Q9UPW6 733 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 ARHGAP42A6NI28 874 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF263O14978 683 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 ALAS1P13196 640 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 FGFR4P22455 802 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 PAX3P23760 479 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 QARSP47897 775 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 FMO5P49326 533 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 MFAP3P55082 362 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 STAT4Q14765 748 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 TRADDQ15628 312 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 ASRGL1Q7L266 308 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 USP6NLQ92738 828 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 PARVBQ9HBI1 364 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 CYLDQ9NQC7 956 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 IKBKGQ9Y6K9 419 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 FRMPD4Q14CM0 1322 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 A0A087X0T9 212 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 CFAP69A5D8W1 941 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 FKBP6O75344 327 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 RAD17O75943 681 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 ESRRBO95718 433 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 ICAM1P05362 532 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 FAM228BP0C875 321 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 SLC9A1P19634 815 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 PTENP60484 403 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 ESRRGP62508 458 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 ARSHQ5FYA8 562 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 C1orf146Q5VVC0 180 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 MFSD5Q6N075 450 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 RFFLQ8WZ73 363 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 CFAP57Q96MR6 1250 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 LXNQ9BS40 222 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 DNAJC18Q9H819 358 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 PICK1Q9NRD5 415 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 NAGPAQ9UK23 515 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 VAV3Q9UKW4 847 aa6.27□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 WDR90Q96KV7 1748 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 I3L4J1 428 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 EPHB6O15197 1021 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 PHF2O75151 1096 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 PSMD10O75832 226 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 CLPTM1O96005 669 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 TMEM253P0C7T8 217 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 CA4P22748 312 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 CAP2P40123 477 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 PTPN5P54829 565 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 MAPK7Q13164 816 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 PLS1Q14651 629 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 TMED2Q15363 201 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 LONRF1Q17RB8 773 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 SLC45A4Q5BKX6 768 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 SMYD1Q8NB12 490 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 TTC8Q8TAM2 541 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 UBN1Q9NPG3 1134 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 TBK1Q9UHD2 729 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 UMODL1Q5DID0 1318 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 MROH7Q68CQ1 1323 aa6.26□□□□□ -1.41
SEH1L-210ENST00000592582 WDR64B1ANS9 1081 aa6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms