RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	PJA2	O43164	708 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	B4GALT4	O60513	344 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	CKB	P12277	381 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	ALAS1	P13196	640 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	BMP7	P18075	431 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	HOXA5	P20719	270 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC29A2	Q14542	456 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	PLA1A	Q53H76	456 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	MZT2A	Q6P582	158 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	ASB12	Q8WXK4	309 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	SPON1	Q9HCB6	807 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	PDP2	Q9P2J9	529 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	CDYL	Q9Y232	598 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608		A0A1B0GVC2	190 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	HMX3	A6NHT5	357 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	DCLK1	O15075	740 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	ITGA5	P08648	1049 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	FCER1A	P12319	257 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	JUP	P14923	745 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	FDXR	P22570	491 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	ATIC	P31939	592 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	CPT1A	P50416	773 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	COPA	P53621	1224 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	PRKAA2	P54646	552 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	MXRA7	P84157	204 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	FCRL6	Q6DN72	434 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	MED25	Q71SY5	747 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	PCGF5	Q86SE9	256 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	FITM2	Q8N6M3	262 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	NAXE	Q8NCW5	288 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	HESX1	Q9UBX0	185 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	GJD2	Q9UKL4	321 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	TPH1	P17752	444 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	EGR1	P18146	543 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	PNLIPRP1	P54315	467 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	SLFN5	Q08AF3	891 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	SYT8	Q8NBV8	401 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	PPM1M	Q96MI6	270 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	C9orf118	A6NHY6	69 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	PRSS47	A8MTI9	375 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	CDC14B	O60729	498 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	CD4	P01730	458 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	ANXA1	P04083	346 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF134	P52741	427 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	CHN2	P52757	468 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	SLURP1	P55000	103 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	LILRA4	P59901	499 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	CUL4B	Q13620	913 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	ARHGEF7	Q14155	803 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	NPY5R	Q15761	445 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		5.72	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms