RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589425.5

PGS1-211, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PGS1, Length 1,944 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-211ENST00000589425 GOLPH3Q9H4A6 298 aa20.9■□□□□ 0.94
PGS1-211ENST00000589425 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
PGS1-211ENST00000589425 CEP83Q9Y592 693 aa20.9■□□□□ 0.94
PGS1-211ENST00000589425 TBKBP1A7MCY6 615 aa20.89■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 M0QYV0 167 aa20.89■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 URI1O94763 535 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 ACRP10323 421 aa20.89■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 KIAA0319Q5VV43 1072 aa20.89■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 TMEM199Q8N511 208 aa20.89■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.89■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.89■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 PAX3P23760 479 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 LHX1P48742 406 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 STILQ15468 1287 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 CCDC142Q17RM4 750 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 ARHGAP17Q68EM7 881 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 TNIP3Q96KP6 325 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 SUSD3Q96L08 255 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 NUP85Q9BW27 656 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 NRP1O14786 923 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 PFKMP08237 780 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 MYBL1P10243 752 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 ODC1P11926 461 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 CCDC130P13994 396 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 HADHBP55084 474 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 PTPN20Q4JDL3 420 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 PKDCCQ504Y2 493 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 TTC30AQ86WT1 665 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 ERICH1Q86X53 443 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 TRIM11Q96F44 468 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 TJP2Q9UDY2 1190 aa20.88■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 FTCDO95954 541 aa20.87■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 CYP11A1P05108 521 aa20.87■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 TOP1MTQ969P6 601 aa20.87■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.87■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 NCK2O43639 380 aa20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 DGKIO75912 1065 aa20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 MTA2O94776 668 aa20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 ALDH2P05091 517 aa20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 LIN9Q5TKA1 542 aa20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 SLFN11Q7Z7L1 901 aa20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 CPXM1Q96SM3 734 aa20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 UVRAGQ9P2Y5 699 aa20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 CALB1P05937 261 aa20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 ADORA2BP29275 332 aa20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 SLC11A1P49279 550 aa20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 CDR1P51861 262 aa20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 DEFB103AP81534 67 aa20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 AMPD2Q01433 879 aa20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 DAAM2Q86T65 1068 aa20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 BTBD6Q96KE9 485 aa20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 TLR10Q9BXR5 811 aa20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 TULP2O00295 520 aa20.85■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 TADA2AO75478 443 aa20.85■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 MAMLD1Q13495 774 aa20.85■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 PTPROQ16827 1216 aa20.85■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 CYP4A22Q5TCH4 519 aa20.85■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.85■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa20.85■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.85■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 METTL23Q86XA0 190 aa20.85■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 SYT15Q9BQS2 421 aa20.85■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 TRIM7Q9C029 511 aa20.85■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 DNAI2Q9GZS0 605 aa20.85■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 L2HGDHQ9H9P8 463 aa20.85■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 HESX1Q9UBX0 185 aa20.85■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 PBX3P40426 434 aa20.84■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 PDCLQ13371 301 aa20.84■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 ANKRD52Q8NB46 1076 aa20.84■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 SLC35F5Q8WV83 523 aa20.84■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 ABCB6Q9NP58 842 aa20.84■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 IL23AQ9NPF7 189 aa20.84■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 DSEQ9UL01 958 aa20.84■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 PCDHB8Q9UN66 801 aa20.84■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.84■□□□□ 0.93
PGS1-211ENST00000589425 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms