RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 ANAPC7Q9UJX3 599 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 TSPAN16Q9UKR8 245 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM191CA6NGB0 347 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 M0QYV0 167 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 MYO1FO00160 1098 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 PROSCO94903 275 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 CXCL10P02778 98 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 PFKMP08237 780 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 MAN1A1P33908 653 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 C2CD6Q53TS8 623 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC181Q5TID7 509 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 GLB1LQ6UWU2 654 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 STK32AQ8WU08 396 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD7Q92527 254 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 SEPT8Q92599 483 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 TNIP3Q96KP6 325 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 PSMB7Q99436 277 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 CARD9Q9H257 536 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM161AQ9NX61 479 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 V9GYY5 206 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 TANC1Q9C0D5 1861 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 DCDC2CA8MYV0 355 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 ENPP3O14638 875 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 POMCP01189 267 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 CAPN2P17655 700 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 PEX5P50542 639 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 PDCLQ13371 301 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 ELF2Q15723 593 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 LLGL2Q6P1M3 1020 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAJC24Q6P3W2 148 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 CD300LGQ6UXG3 332 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 MMGT1Q8N4V1 131 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 UBL4BQ8N7F7 174 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 C12orf29Q8N999 325 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 C18orf8Q96DM3 657 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 BTBD6Q96KE9 485 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 MIS12Q9H081 205 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 DPEP3Q9H4B8 488 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC66A2RUB6 948 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 CASTOR2A6NHX0 329 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 LMO2P25791 158 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 LHX1P48742 406 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 FAAP100Q0VG06 881 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 CLLU1OSQ5K130 101 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 TEX35Q5T0J7 233 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 WSCD1Q658N2 575 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 C3orf58Q8NDZ4 430 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATA4Q8NEY3 305 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 DBF4BQ8NFT6 615 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 MCRS1Q96EZ8 462 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 MS4A14Q96JA4 679 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 CPXM1Q96SM3 734 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 KANSL3Q9P2N6 904 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 IP6K2Q9UHH9 426 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 SIGLEC16A6NMB1 481 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 GJA8P48165 433 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 DSC1Q08554 894 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 NOMO2Q5JPE7 1267 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 TTC30AQ86WT1 665 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 XYLT1Q86Y38 959 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD52Q8NB46 1076 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 UBA3Q8TBC4 463 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 URGCPQ8TCY9 931 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC4A5Q9BY07 1137 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM7Q9C029 511 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 CACNG4Q9UBN1 327 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 HESX1Q9UBX0 185 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-207ENST00000589146 CENPFP49454 3210 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 M0QZQ0 153 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 SPOPO43791 374 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP104O60308 925 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 ERBB2P04626 1255 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP11A1P05108 521 aa24.07■■□□□ 1.44
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CAPNS1-207ENST00000589146 RPL34P49207 117 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 DNA2P51530 1060 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 TLE2Q04725 743 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 CLUL1Q15846 466 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPROQ16827 1216 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM60Q495X7 471 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 DCAF12L1Q5VU92 463 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 DSTYKQ6XUX3 929 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC35F5Q8WV83 523 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 ALG3Q92685 438 aa24.07■■□□□ 1.44
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