RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 WDR49Q8IV35 697 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 LRRC52Q8N7C0 313 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 XXYLT1Q8NBI6 393 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 LEMD2Q8NC56 503 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 SHKBP1Q8TBC3 707 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 HPDLQ96IR7 371 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 ZSWIM3Q96MP5 696 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 PHOX2BQ99453 314 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 CGRRF1Q99675 332 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 RTP3Q9BQQ7 232 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 PI4K2AQ9BTU6 479 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 FOXQ1Q9C009 403 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 DNAJC25Q9H1X3 360 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 ATXN3LQ9H3M9 355 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 ZFP14Q9HCL3 533 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 SIX4Q9UIU6 781 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-209ENST00000587957 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SMAPO00193 183 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 KLRC4O43908 158 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 ECI2O75521 394 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 RPN1P04843 607 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 DCNP07585 359 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 ATF6P18850 670 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 VIPR2P41587 438 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 TUFMP49411 452 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 CASP4P49662 377 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 GPR15P49685 360 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 PRSS12P56730 875 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 CYP4F8P98187 520 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 PFKPQ01813 784 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 EHHADHQ08426 723 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 STK4Q13043 487 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 BIRC3Q13489 604 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 TRPC3Q13507 836 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC142Q17RM4 750 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SDHAF4Q5VUM1 108 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 LRRTM3Q86VH5 581 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 OSTM1Q86WC4 334 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 YAF2Q8IY57 180 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 KIAA0895Q8NCT3 520 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 TTC16Q8NEE8 873 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SPPL2BQ8TCT7 592 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 BORCS6Q96GS4 357 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 ASB16Q96NS5 453 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 BRD9Q9H8M2 597 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 TMLHEQ9NVH6 421 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 USP25Q9UHP3 1055 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 LRRN2O75325 713 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 MOSPD3O75425 235 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 CD72P21854 359 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 FCARP24071 287 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 PCSK1P29120 753 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 GDI1P31150 447 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 MRE11P49959 708 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 TNNC1P63316 161 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 PSMD6Q15008 389 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 BMT2Q1RMZ1 405 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 GPR158Q5T848 1215 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 CEP135Q66GS9 1140 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 TPRG1Q6ZUI0 275 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 TMC8Q8IU68 726 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SCN4BQ8IWT1 228 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM86AQ8N2M4 240 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 TOP6BLQ8N6T0 577 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 GOLGA5Q8TBA6 731 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SMARCD2Q92925 531 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 PSMG2Q969U7 264 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 ELSPBP1Q96BH3 223 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SHDQ96IW2 340 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 HEBP1Q9NRV9 189 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 GTF3C4Q9UKN8 822 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 HPSEQ9Y251 543 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 MIA3Q5JRA6 1907 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 PDGFRBP09619 1106 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 LHX1P48742 406 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 EPHA5P54756 1037 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms