RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-208ENST00000579743 PDE11AQ9HCR9 933 aa14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 FAM13BQ9NYF5 915 aa14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 EHD2Q9NZN4 543 aa14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 SCN1AP35498 2009 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 CYP4F8P98187 520 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 FZD5Q13467 585 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 ATL3Q6DD88 541 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 ADGRF2Q8IZF7 708 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 DHX58Q96C10 678 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 HPDLQ96IR7 371 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 TRIM9Q9C026 710 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 EPC1Q9H2F5 836 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 TDP1Q9NUW8 608 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 INTS13Q9NVM9 706 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 CFAP45Q9UL16 551 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 L1RE1Q9UN81 338 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 ANK1P16157 1881 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 ARNTLO00327 626 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 CHRNB1P11230 501 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 CTHP32929 405 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 CNR2P34972 360 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 PDE6CP51160 858 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 NLRP12P59046 1061 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 TSSK4Q6SA08 328 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 WDR49Q8IV35 697 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 MAB21L3Q8N8X9 362 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 NELL1Q92832 810 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 SNX21Q969T3 373 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 SLC46A2Q9BY10 475 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 HSPBP1Q9NZL4 362 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 F5P12259 2224 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 PATJQ8NI35 1801 aa14.71□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 UBE4BO95155 1302 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 FANCMQ8IYD8 2048 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 A0A087X0B3 334 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 LILRB5O75023 590 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 ATG13O75143 517 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 TNNI1P19237 187 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 ANXA13P27216 316 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 ME1P48163 572 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 CDR1P51861 262 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 CNNM4Q6P4Q7 775 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 MON1AQ86VX9 555 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 CEP57L1Q8IYX8 460 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 MMS19Q96T76 1030 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 MKNK1Q9BUB5 465 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 IL21Q9HBE4 155 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 GKN1Q9NS71 199 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 GTSE1Q9NYZ3 720 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 CDH9Q9ULB4 789 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 TSC2P49815 1807 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 CLSTN1O94985 981 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 PRAMEF12O95522 483 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 F11P03951 625 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 USP17L7P0C7H9 530 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 CYP2F1P24903 491 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 SOX9P48436 509 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 ARHGAP8P85298 464 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 NR1H3Q13133 447 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 TRPC3Q13507 836 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 PON2Q15165 354 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 PDGFRLQ15198 375 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 DDR2Q16832 855 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 VSTM1Q6UX27 236 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 UNC13DQ70J99 1090 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 XXYLT1Q8NBI6 393 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 TTC8Q8TAM2 541 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-208ENST00000579743 ZNF507Q8TCN5 953 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms