RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 PIRO00625 290 aa18.94■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 CYB561D2O14569 222 aa18.94■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 F11P03951 625 aa18.94■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 SLC12A3P55017 1021 aa18.94■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM132DQ14C87 1099 aa18.94■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 KYAT1Q16773 422 aa18.94■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 SDHAF4Q5VUM1 108 aa18.94■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 DTHD1Q6ZMT9 781 aa18.94■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 SYT13Q7L8C5 426 aa18.94■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 THEM5Q8N1Q8 247 aa18.94■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 CPA6Q8N4T0 437 aa18.94■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 FAM184AQ8NB25 1140 aa18.94■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 SPPL2BQ8TCT7 592 aa18.94■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 ZMYM5Q9UJ78 669 aa18.94■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 DSEQ9UL01 958 aa18.94■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 ASPMQ8IZT6 3477 aa18.94■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 IGF2RP11717 2491 aa18.93■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 H0YCG3 227 aa18.93■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 K7ENM7 598 aa18.93■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 PLA2G4BP0C869 781 aa18.93■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP18.93■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 MTF1Q14872 753 aa18.93■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 PDGFRLQ15198 375 aa18.93■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 FBXO43Q4G163 708 aa18.93■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 WSCD1Q658N2 575 aa18.93■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 ABCA7Q8IZY2 2146 aa18.93■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 CD101Q93033 1021 aa18.93■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 ACDQ96AP0 544 aa18.93■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 ECT2Q9H8V3 914 aa18.93■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 TRPC7Q9HCX4 862 aa18.93■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM9BQ9NQ34 198 aa18.93■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 TBX20Q9UMR3 447 aa18.93■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 WASF3Q9UPY6 502 aa18.93■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 WNT6Q9Y6F9 365 aa18.93■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 ATRXP46100 2492 aa18.93■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 ANO9A1A5B4 782 aa18.92■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 ADRB2P07550 413 aa18.92■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 UAP1L1Q3KQV9 507 aa18.92■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 PMS2CLQ68D20 193 aa18.92■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 KIAA1211LQ6NV74 962 aa18.92■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 TSTD1Q8NFU3 115 aa18.92■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa18.92■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 TSPAN18Q96SJ8 248 aa18.92■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 PI4K2AQ9BTU6 479 aa18.92■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 SCNM1Q9BWG6 230 aa18.92■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 TMLHEQ9NVH6 421 aa18.92■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 EBF1Q9UH73 591 aa18.92■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 A0A0B4J269 797 aa18.91■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 LAD1O00515 517 aa18.91■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 TADA3O75528 432 aa18.91■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 BCKDHBP21953 392 aa18.91■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 PRPHP41219 470 aa18.91■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 IFNAR2P48551 515 aa18.91■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 ACOT2P49753 483 aa18.91■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 TAF6P49848 677 aa18.91■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 SEC13P55735 322 aa18.91■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 ARSHQ5FYA8 562 aa18.91■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 HYIQ5T013 277 aa18.91■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 SLC39A4Q6P5W5 647 aa18.91■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 CYP2U1Q7Z449 544 aa18.91■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 MON1AQ86VX9 555 aa18.91■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 CD302Q8IX05 232 aa18.91■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 DEFB124Q8NES8 71 aa18.91■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 EXOC4Q96A65 974 aa18.91■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 REEP2Q9BRK0 252 aa18.91■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa18.91■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 PIGRP01833 764 aa18.9■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 PAX3P23760 479 aa18.9■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 SMARCB1Q12824 385 aa18.9■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF77Q15935 545 aa18.9■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 ANO7Q6IWH7 933 aa18.9■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 TTC30AQ86WT1 665 aa18.9■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 OSCP1Q8WVF1 389 aa18.9■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 GATA6Q92908 595 aa18.9■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 SLC22A12Q96S37 553 aa18.9■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 DPP3Q9NY33 737 aa18.9■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 KCND2Q9NZV8 630 aa18.9■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa18.9■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa18.9■□□□□ 0.62
CCDC40-211ENST00000574099 AKAP13Q12802 2813 aa18.89■□□□□ 0.61
CCDC40-211ENST00000574099 ANTXRLA6NF34 631 aa18.89■□□□□ 0.61
CCDC40-211ENST00000574099 TISP43B9A030 160 aa18.89■□□□□ 0.61
CCDC40-211ENST00000574099 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms