RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564534.1

LINC01858-201, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1858, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC01858, Length 1,838 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01858-201ENST00000564534 THEM5Q8N1Q8 247 aa9.61□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 OR6B3Q8NGW1 331 aa9.61□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 ARID3AQ99856 593 aa9.61□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 EDEM3Q9BZQ6 932 aa9.61□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 GANQ9H2C0 597 aa9.61□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa9.61□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 FHOD1Q9Y613 1164 aa9.61□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 H7C4K7 107 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 NOL4O94818 638 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 EFEMP2O95967 443 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 WARSP23381 471 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 PCSK1P29120 753 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 CDC25BP30305 580 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 RAP1GAPP47736 663 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 CDH8P55286 799 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 CREMQ03060 361 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 ZNF280DQ6N043 979 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 GJB7Q6PEY0 223 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 ANKS3Q6ZW76 656 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 TMC6Q7Z403 805 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 LIMS2Q7Z4I7 341 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 UNC93AQ86WB7 457 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 FMNL3Q8IVF7 1028 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 VPS52Q8N1B4 723 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 PRR7Q8TB68 274 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 KREMEN1Q96MU8 473 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 STK33Q9BYT3 514 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 NLRC4Q9NPP4 1024 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 CISHQ9NSE2 258 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 CHD9Q3L8U1 2897 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 TMEM265A0A087WTH1 108 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 A0A1W2PQJ5 194 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 A8MXQ7 604 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 H3BNC9 293 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 LCE2BO14633 110 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 GABRDO14764 452 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 EPHB6O15197 1021 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 OAZ2O95190 189 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 KRT5P13647 590 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 USP8P40818 1118 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 DSG1Q02413 1049 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 INCA1Q0VD86 236 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 GPM6BQ13491 265 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 RTP2Q5QGT7 225 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 TMC7Q7Z402 723 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 GPR65Q8IYL9 337 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 POF1BQ8WVV4 589 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 SHC3Q92529 594 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 KAT5Q92993 513 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 VN1R3Q9BXE9 311 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 ZBP1Q9H171 429 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 SDCBP2Q9H190 292 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 CERS4Q9HA82 394 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 TLR9Q9NR96 1032 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 CHST7Q9NS84 486 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 MYO6Q9UM54 1294 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa9.59□□□□□ -0.87
LINC01858-201ENST00000564534 OR6C75A6NL08 312 aa9.59□□□□□ -0.88
LINC01858-201ENST00000564534 F8VZ95 297 aa9.59□□□□□ -0.88
LINC01858-201ENST00000564534 C2CD2LO14523 706 aa9.59□□□□□ -0.88
LINC01858-201ENST00000564534 LPXNO60711 386 aa9.59□□□□□ -0.88
LINC01858-201ENST00000564534 CILPO75339 1184 aa9.59□□□□□ -0.88
LINC01858-201ENST00000564534 CCNYL3P0C7X3 344 aa9.59□□□□□ -0.88
LINC01858-201ENST00000564534 CTSAP10619 480 aa9.59□□□□□ -0.88
LINC01858-201ENST00000564534 CA8P35219 290 aa9.59□□□□□ -0.88
LINC01858-201ENST00000564534 STAT1P42224 750 aa9.59□□□□□ -0.88
LINC01858-201ENST00000564534 NDST1P52848 882 aa9.59□□□□□ -0.88
LINC01858-201ENST00000564534 TSPY1Q01534 308 aa9.59□□□□□ -0.88
LINC01858-201ENST00000564534 PSMD5Q16401 504 aa9.59□□□□□ -0.88
LINC01858-201ENST00000564534 CTXN3Q4LDR2 81 aa9.59□□□□□ -0.88
LINC01858-201ENST00000564534 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.88
LINC01858-201ENST00000564534 TMEM270Q6UE05 265 aa9.59□□□□□ -0.88
LINC01858-201ENST00000564534 TAS1R1Q7RTX1 841 aa9.59□□□□□ -0.88
LINC01858-201ENST00000564534 SPRED2Q7Z698 418 aa9.59□□□□□ -0.88
LINC01858-201ENST00000564534 SPPL3Q8TCT6 385 aa9.59□□□□□ -0.88
LINC01858-201ENST00000564534 CPLX3Q8WVH0 158 aa9.59□□□□□ -0.88
LINC01858-201ENST00000564534 PIK3R5Q8WYR1 880 aa9.59□□□□□ -0.88
LINC01858-201ENST00000564534 TNIP3Q96KP6 325 aa9.59□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms