RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558861.1

LRRC28-209, Transcript of leucine rich repeat containing 28, humanhuman

TSL 3

Gene LRRC28, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28-209ENST00000558861 Q6ZUG5 572 aa7□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 GPR155Q7Z3F1 870 aa7□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 RASAL3Q86YV0 1011 aa7□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 SIAH1Q8IUQ4 282 aa7□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 TBC1D10CQ8IV04 446 aa7□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 PPM1NQ8N819 430 aa7□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa7□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 THSD7BQ9C0I4 1608 aa7□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 CENPFP49454 3210 aa7□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 PLIN4Q96Q06 1357 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 ORC4O43929 436 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 NDUFS2O75306 463 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 HLA-DOAP06340 250 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 CYP21A2P08686 494 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 AKR1B1P15121 316 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 NF2P35240 595 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 MGAT5Q09328 741 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 PRKG1Q13976 671 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 NECTIN1Q15223 517 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 PKN1Q16512 942 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 RGMBQ6NW40 437 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 STOX1Q6ZVD7 989 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 CHPFQ8IZ52 775 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 SCYL3Q8IZE3 742 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 RUFY2Q8WXA3 655 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 IL17RAQ96F46 866 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 WDR92Q96MX6 357 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 NAPBQ9H115 298 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 NUAK1O60285 661 aa6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 NRP2O60462 931 aa6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 IL33O95760 270 aa6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 TDO2P48775 406 aa6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 RRADP55042 308 aa6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 ADRM1Q16186 407 aa6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 ERO1BQ86YB8 467 aa6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 TPH2Q8IWU9 490 aa6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 NACAP1Q9BZK3 213 aa6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 KATNBL1Q9H079 304 aa6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 SWAP70Q9UH65 585 aa6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 NEDD4P46934 1319 aa6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 BRCA2P51587 3418 aa6.98□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 LAMB1P07942 1786 aa6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 LAMA4Q16363 1823 aa6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 PHIPQ8WWQ0 1821 aa6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 A0A1W2PRG0 241 aa6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 PRDM1O75626 825 aa6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 GH2P01242 217 aa6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 CSF2RBP32927 897 aa6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 NRG3P56975 720 aa6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 HAND2P61296 217 aa6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 PPATQ06203 517 aa6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 CD69Q07108 199 aa6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 MALLQ13021 153 aa6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 PPIL2Q13356 520 aa6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 PCOLCEQ15113 449 aa6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 DEFB115Q30KQ5 88 aa6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 AJUBAQ96IF1 538 aa6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 CAPNS2Q96L46 248 aa6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 CCDC17Q96LX7 622 aa6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 PTPN18Q99952 460 aa6.97□□□□□ -1.29
LRRC28-209ENST00000558861 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms