RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554184.5

CCNB1IP1-210, Transcript of cyclin B1 interacting protein 1, human

TSL 3

Gene CCNB1IP1, Length 513 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	AREL1	O15033	823 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FFAR2	O15552	330 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	A1BG	P04217	495 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SPATA31D3	P0C874	917 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FGFR4	P22455	802 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KLRC1	P26715	233 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ITGA8	P53708	1063 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LILRA4	P59901	499 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MC2R	Q01718	297 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF844	Q08AG5	666 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TCF15	Q12870	199 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	IQCB1	Q15051	598 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184		Q8NA96	180 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MUL1	Q969V5	352 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PNKP	Q96T60	521 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SUN1	O94901	812 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZFPL1	O95159	310 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	IL1R2	P27930	398 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FAM189B	P81408	668 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	OCA2	Q04671	838 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GRM1	Q13255	1194 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NPY5R	Q15761	445 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PLSCR1	O15162	318 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CYP27B1	O15528	508 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FAM20B	O75063	409 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GPANK1	O95872	356 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TYRP1	P17643	537 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GABRB3	P28472	473 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ADAM17	P78536	824 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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