RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 CHST7Q9NS84 486 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 SPTLC3Q9NUV7 552 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 TMEM30AQ9NV96 361 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 TAS2R14Q9NYV8 317 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 DSEQ9UL01 958 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 MTUS1Q9ULD2 1270 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 EPOPA6NHQ4 379 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 TULP2O00295 520 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 CLDN5O00501 218 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 C2CD2LO14523 706 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 THAP12O43422 761 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 TRAPPC3O43617 180 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 MICAL2O94851 1124 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 CSPG5O95196 566 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 VNN2O95498 520 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 SOD2P04179 222 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 RPL17P18621 184 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 COL9A1P20849 921 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 PLA2G5P39877 138 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 LHX1P48742 406 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 PDE6CP51160 858 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 KIF11P52732 1056 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 CACNA2D1P54289 1103 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 CYP27A1Q02318 531 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 CAMK1Q14012 370 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 MDH1BQ5I0G3 518 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 CYP26C1Q6V0L0 522 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 TTC30AQ86WT1 665 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 METTL23Q86XA0 190 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 PASD1Q8IV76 773 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 TDHQ8IZJ6 230 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 FUKQ8N0W3 1084 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 VPS52Q8N1B4 723 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 WDTC1Q8N5D0 677 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 ACRBPQ8NEB7 543 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 SPATA18Q8TC71 538 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 MYLPFQ96A32 169 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 TTPALQ9BTX7 342 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 B3GNT5Q9BYG0 378 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 ZBP1Q9H171 429 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 CYTH4Q9UIA0 394 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 GTF3C4Q9UKN8 822 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 CDH9Q9ULB4 789 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 TFR2Q9UP52 801 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 RCCD1A6NED2 376 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 C5orf67F2Z3F1 127 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 GRM6O15303 877 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 LILRB3O75022 631 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 NDUFA10O95299 355 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 VDRP11473 427 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 DNAJB2P25686 324 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 PCSK1P29120 753 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 ADORA2BP29275 332 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 PPM1AP35813 382 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 GLUD2P49448 558 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 NOMO3P69849 1222 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 PLCB3Q01970 1234 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 DSG1Q02413 1049 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 USP41Q3LFD5 358 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 CTXN3Q4LDR2 81 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 PKDCCQ504Y2 493 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 SGO2Q562F6 1265 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 ZNF280DQ6N043 979 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 FAM171BQ6P995 826 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 TMTC1Q8IUR5 882 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 TTC39CQ8N584 583 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 TTC9BQ8N6N2 239 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 CCDC112Q8NEF3 446 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 UBA3Q8TBC4 463 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 SPPL3Q8TCT6 385 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 SLC2A14Q8TDB8 520 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 CYFIP2Q96F07 1278 aa8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms