RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 PHACTR2O75167 634 aa18.14■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 CD72P21854 359 aa18.14■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 CMA1P23946 247 aa18.14■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 AVPR1AP37288 418 aa18.14■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 PLCB2Q00722 1185 aa18.14■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa18.14■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 GAREM2Q75VX8 874 aa18.14■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 LRRTM3Q86VH5 581 aa18.14■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 SCFD1Q8WVM8 642 aa18.14■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 CCDC127Q96BQ5 260 aa18.14■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 PI4K2AQ9BTU6 479 aa18.14■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 SNX25Q9H3E2 840 aa18.14■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa18.14■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 SERTAD1Q9UHV2 236 aa18.14■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 PIAS3Q9Y6X2 628 aa18.14■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa18.14■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 WEE1P30291 646 aa18.13■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 RPS9P46781 194 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 WNT7BP56706 349 aa18.13■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 TNNC1P63316 161 aa18.13■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 CUL4BQ13620 913 aa18.13■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 PKP1Q13835 747 aa18.13■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 PSMD6Q15008 389 aa18.13■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa18.13■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 FAM3CQ92520 227 aa18.13■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 CGRRF1Q99675 332 aa18.13■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 IER2Q9BTL4 223 aa18.13■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 EHD2Q9NZN4 543 aa18.13■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 SIX4Q9UIU6 781 aa18.13■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 FBXO4Q9UKT5 387 aa18.13■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 CDH9Q9ULB4 789 aa18.13■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 TSC2P49815 1807 aa18.12■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 PRR23AA6NEV1 266 aa18.12■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 SOBPA7XYQ1 873 aa18.12■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 TGFB1I1O43294 461 aa18.12■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 ATF6P18850 670 aa18.12■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 CDR1P51861 262 aa18.12■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 AP3M2P53677 418 aa18.12■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 CYP24A1Q07973 514 aa18.12■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 BECN1Q14457 450 aa18.12■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 BMT2Q1RMZ1 405 aa18.12■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 C12orf56Q8IXR9 622 aa18.12■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 FSIP1Q8NA03 581 aa18.12■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 OR5B17Q8NGF7 314 aa18.12■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 BPIFB1Q8TDL5 484 aa18.12■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 PAGE5Q96GU1 130 aa18.12■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 GTF3C4Q9UKN8 822 aa18.12■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 A0A1B0GVL5 298 aa18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 LMNAP02545 664 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 FAM163BP0C2L3 166 aa18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 SP9P0CG40 484 aa18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 PFKFB1P16118 471 aa18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 TARSP26639 723 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 ANXA13P27216 316 aa18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 CASP1P29466 404 aa18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 HOXD13P35453 343 aa18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 SYKP43405 635 aa18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 CYP4F8P98187 520 aa18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 EHHADHQ08426 723 aa18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 FCHO2Q0JRZ9 810 aa18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 LRRC32Q14392 662 aa18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 SOWAHAQ2M3V2 549 aa18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 ZNF528Q3MIS6 628 aa18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 POTEHQ6S545 545 aa18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 SCN4BQ8IWT1 228 aa18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 ATRIPQ8WXE1 791 aa18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 EXOC4Q96A65 974 aa18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 CLDN23Q96B33 292 aa18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 SYT15Q9BQS2 421 aa18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 GABRDO14764 452 aa18.1■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 KINO60870 393 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 LRRN2O75325 713 aa18.1■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 CYP2F1P24903 491 aa18.1■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 ATICP31939 592 aa18.1■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 AMPD2Q01433 879 aa18.1■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 BIRC3Q13489 604 aa18.1■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 CFAP221Q4G0U5 840 aa18.1■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 STXBP5Q5T5C0 1151 aa18.1■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 VSTM1Q6UX27 236 aa18.1■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 ASCL5Q7RTU5 278 aa18.1■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa18.1■□□□□ 0.49
CASP9-211ENST00000546969 CMTM8Q8IZV2 173 aa18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms