RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538886.5

GGA3-202, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 3,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-202ENST00000538886 POU5F1BQ06416 359 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 MIB1Q86YT6 1006 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 CYFIP2Q96F07 1278 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 H7C4K7 107 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 GJA1P17302 382 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 CORO7P57737 925 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 GNG11P61952 73 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 PSMD6Q15008 389 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 UBXN11Q5T124 520 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 CISHQ9NSE2 258 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 ITGA11Q9UKX5 1188 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 UBE4BO95155 1302 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 TTC26A0AVF1 554 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 BNIP3LO60238 219 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 DGKIO75912 1065 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 CCDC130P13994 396 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 WEE1P30291 646 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 CCT5P48643 541 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 SGO2Q562F6 1265 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 ARMC3Q5W041 872 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 MSANTD4Q8NCY6 345 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 LINC01599Q8WXQ3 324 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 IGSF21Q96ID5 467 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 PTGESO14684 152 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 NSFP46459 744 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 AP3M2P53677 418 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 MGAT3Q09327 533 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 PLD1Q13393 1074 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 GRIN2CQ14957 1233 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 TCTN1Q2MV58 587 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 SLC30A5Q8TAD4 765 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 TTC8Q8TAM2 541 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 SLC2A14Q8TDB8 520 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 SLC35C1Q96A29 364 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 DOCK5Q9H7D0 1870 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 NAGPAQ9UK23 515 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 RPSAP08865 295 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 GTF2H1P32780 548 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 HOXD13P35453 343 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 ANKS3Q6ZW76 656 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 TAS1R1Q7RTX1 841 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 HERVK_113Q902F9 699 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 FUCA2Q9BTY2 467 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 RFPL2O75678 378 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 CYP2F1P24903 491 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 LMO2P25791 158 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 IRS1P35568 1242 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 KRT82Q9NSB4 513 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 C2CD2Q9Y426 696 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 SQORQ9Y6N5 450 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 F8VP50 259 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 ZNF623O75123 536 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 RPL9P32969 192 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 WNT7BP56706 349 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 CCDC142Q17RM4 750 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 C4orf50Q6ZRC1 276 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 DNAAF5Q86Y56 855 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 YAF2Q8IY57 180 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 C11orf70Q9BRQ4 267 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 MKNK1Q9BUB5 465 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 FAM200BP0CF97 657 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 EPHB3P54753 998 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 CUL2Q13617 745 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 LONRF2Q1L5Z9 754 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 CPA5Q8WXQ8 436 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 NFKBIZQ9BYH8 718 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-202ENST00000538886 CCDC113Q9H0I3 377 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms