RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.27□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.27□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 H0YIZ8 118 aa6.26□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 QSOX1O00391 747 aa6.26□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 ZNF213O14771 459 aa6.26□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 TLR5O60602 858 aa6.26□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 KATNA1O75449 491 aa6.26□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 MPGP29372 298 aa6.26□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP10-9P60411 292 aa6.26□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 NOGQ13253 232 aa6.26□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa6.26□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 ICE2Q659A1 982 aa6.26□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 SLC9A4Q6AI14 798 aa6.26□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 TMEM108Q6UXF1 575 aa6.26□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 DTX2Q86UW9 622 aa6.26□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 CPA6Q8N4T0 437 aa6.26□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 RGMAQ96B86 450 aa6.26□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 ABCF2Q9UG63 623 aa6.26□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 TISP43B9A030 160 aa6.25□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 SMIM22K7EJ46 135 aa6.25□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 PPP6CO00743 305 aa6.25□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 IKBKBO14920 756 aa6.25□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 IGKV2-30P06310 120 aa6.25□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 CYP2D6P10635 497 aa6.25□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 ODF1Q14990 250 aa6.25□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.25□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa6.25□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 DENND1AQ8TEH3 1009 aa6.25□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.25□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.25□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 ZNF521Q96K83 1311 aa6.25□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 ONECUT2O95948 504 aa6.24□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 TUBB4AP04350 444 aa6.24□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 CCND1P24385 295 aa6.24□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 CYP2C18P33260 490 aa6.24□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 CLCN2P51788 898 aa6.24□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 HK3P52790 923 aa6.24□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 SLC18B1Q6NT16 456 aa6.24□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 MAVSQ7Z434 540 aa6.24□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.24□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 ZBTB9Q96C00 473 aa6.24□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 DLL3Q9NYJ7 618 aa6.24□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 ALG1L2C9J202 215 aa6.23□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.23□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 CEP78Q5JTW2 689 aa6.23□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 PCID2Q5JVF3 399 aa6.23□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 TREML2Q5T2D2 321 aa6.23□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 LAYNQ6UX15 382 aa6.23□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 FAM167AQ96KS9 214 aa6.23□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.23□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.23□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa6.22□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 PRRT4C9JH25 899 aa6.22□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 MOSPD3O75425 235 aa6.22□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 PDCP20941 246 aa6.22□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 LIPAP38571 399 aa6.22□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 ZNF134P52741 427 aa6.22□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 LOXL3P58215 753 aa6.22□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.22□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.22□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.22□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.22□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.22□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 HESX1Q9UBX0 185 aa6.22□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 TNKSO95271 1327 aa6.22□□□□□ -1.41
SGCE-211ENST00000522045 MYO1FO00160 1098 aa6.21□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 DNAJB5O75953 348 aa6.21□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 AHSGP02765 367 aa6.21□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 TYRP14679 529 aa6.21□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 ENGP17813 658 aa6.21□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 PXNP49023 591 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 LONRF3Q496Y0 759 aa6.21□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.21□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 SERTAD3Q9UJW9 196 aa6.21□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 KCNAB3O43448 404 aa6.2□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 NPSP0C0P6 89 aa6.2□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 USP45Q70EL2 814 aa6.2□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 PRR18Q8N4B5 295 aa6.2□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
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