RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM51Q9BSJ1 452 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 PREBQ9HCU5 417 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 KLHL11Q9NVR0 708 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 GTF3C4Q9UKN8 822 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 AGAP1Q9UPQ3 857 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 C15orf41Q9Y2V0 281 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 LRRD1A4D1F6 860 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TTLL13PA6NNM8 815 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ACKR2O00590 384 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ALDH3A1P30838 453 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 KCNJ1P48048 391 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ATP1A2P50993 1020 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 FMO1Q01740 532 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 GLRA4Q5JXX5 417 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 EMC10Q5UCC4 262 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SLC15A3Q8IY34 581 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 FUKQ8N0W3 1084 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 HELQQ8TDG4 1101 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TEKT4Q8WW24 435 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 KRT35Q92764 455 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHB18PQ96TA0 734 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 STRA6Q9BX79 667 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PRELID1Q9Y255 219 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CLTAP09496 248 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC166P0CW27 439 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 RAP1GAPP47736 663 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF132P52740 706 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CDH8P55286 799 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ACVR2BQ13705 512 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SCYL2Q6P3W7 929 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 BRSK2Q8IWQ3 736 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 C1orf54Q8WWF1 131 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ACAP3Q96P50 834 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 FAM118BQ9BPY3 351 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TINF2Q9BSI4 451 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 VIPAS39Q9H9C1 493 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 VTA1Q9NP79 307 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 UVRAGQ9P2Y5 699 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PI4K2BG5E9Z4 385 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 M0QZ92 97 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 GJB6O95452 261 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 GAS8O95995 478 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 STAG3L1P0CL83 205 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CYP2C9P11712 490 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 GJA5P36382 358 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PSMC4P43686 418 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MARCKSL1P49006 195 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 DYNLT1P63172 113 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PPP2R5EQ16537 467 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 KRT71Q3SY84 523 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF484Q5JVG2 852 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 C1orf220Q5T0J3 134 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TEX9Q8N6V9 391 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 LMO3Q8TAP4 145 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CCHCR1Q8TD31 782 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF516Q92618 1163 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 HAUS1Q96CS2 278 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 OSMRQ99650 979 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CARD9Q9H257 536 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SPC25Q9HBM1 224 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CISHQ9NSE2 258 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PCMTD2Q9NV79 361 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 UMODL1Q5DID0 1318 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PFDN1O60925 122 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 HOXD12P35452 270 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 AP3M2P53677 418 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MYO1EQ12965 1108 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ACCSLQ4AC99 568 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF606Q8WXB4 792 aa8.26□□□□□ -1.09
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