RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518681.5

MIB2-231, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene MIB2, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-231	ENST00000518681	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	19.87	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	POLI	Q9UNA4	740 aa		19.87	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		19.87	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	PSMA2	P25787	234 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	MOGS	Q13724	837 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	CCNB1	P14635	433 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	FAXC	Q5TGI0	409 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	CCDC125	Q86Z20	511 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	CEP120	Q8N960	986 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	TTC17	Q96AE7	1141 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	CALN1	Q9BXU9	219 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	CISH	Q9NSE2	258 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	FAM155B	O75949	473 aa		19.85	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	CPA2	P48052	419 aa		19.85	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		19.85	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		19.85	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		19.85	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	19.85	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	PAFAH2	Q99487	392 aa		19.85	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		19.85	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		19.85	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	19.85	■□□□□ 0.77	1e-6	■□□□□ 11.3
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM63A	O94886	807 aa		19.85	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	PDK4	Q16654	411 aa		19.85	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		19.85	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	19.85	■□□□□ 0.77	2e-6	■■■□□ 18.3
MIB2-231	ENST00000518681	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		19.85	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	C10orf82	Q8WW14	230 aa		19.85	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	CDKN2B	P42772	138 aa		19.85	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	MMRN1	Q13201	1228 aa		19.85	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	PALM2	Q8IXS6	379 aa		19.85	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	19.85	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		19.85	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		19.85	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681		F5H423	210 aa	Predicted RBP	19.84	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	ABL2	P42684	1182 aa		19.84	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	19.84	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	19.84	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		19.84	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		19.84	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	RPAIN	Q86UA6	219 aa		19.84	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	TRIM50	Q86XT4	487 aa		19.84	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		19.84	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	CPT1B	Q92523	772 aa		19.84	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	19.84	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	SYNC	Q9H7C4	482 aa		19.84	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	TBC1D12	O60347	775 aa		19.84	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	GRAP2	O75791	330 aa		19.84	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		19.84	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	TTC7B	Q86TV6	843 aa		19.84	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		19.84	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	LPAR1	Q92633	364 aa		19.84	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	ARMCX1	Q9P291	453 aa		19.84	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		19.84	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		19.84	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		19.83	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	PEX11A	O75192	247 aa		19.83	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	19.83	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		19.83	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	RFX6	Q8HWS3	928 aa		19.83	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	NIM1K	Q8IY84	436 aa		19.83	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		19.83	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	19.83	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		19.83	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		19.83	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	19.83	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF302	Q9NR11	478 aa		19.83	■□□□□ 0.77
MIB2-231	ENST00000518681	TYROBP	O43914	113 aa		19.83	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	ALDH3A1	P30838	453 aa		19.83	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	CDO1	Q16878	200 aa		19.83	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		19.83	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	CGRRF1	Q99675	332 aa		19.83	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	CENPF	P49454	3210 aa		19.83	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	ATP2A1	O14983	1001 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	ALOX15B	O15296	676 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	NR1H3	Q13133	447 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	CRYM	Q14894	314 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		19.82	■□□□□ 0.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms