RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515753.1

HERC4-215, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 2

Gene HERC4, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HERC4-215	ENST00000515753	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	FAM227A	F5H4B4	570 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	MPPED1	O15442	326 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	TSPAN6	O43657	245 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	TUSC2	O75896	110 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	DNAJB5	O75953	348 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	CELA2A	P08217	269 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	HTR1B	P28222	390 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	ARFIP2	P53365	341 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	PTPRR	Q15256	657 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	TIMP4	Q99727	224 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753		H3BUI4	141 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	TOR1B	O14657	336 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	FRS3	O43559	492 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	AHSG	P02765	367 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	GATA3	P23771	443 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	ITPKB	P27987	946 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	CTGF	P29279	349 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	NPTX2	P47972	431 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	SOX8	P57073	446 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	NXPH1	P58417	271 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	GPSM2	P81274	684 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	FPGS	Q05932	587 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	ITIH3	Q06033	890 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	FGL2	Q14314	439 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	USP37	Q86T82	979 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	CERS3	Q8IU89	383 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	LPIN2	Q92539	896 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	PGBD1	Q96JS3	809 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753		A0A0B4J269	797 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	ORC4	O43929	436 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	HRG	P04196	525 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	TH	P07101	528 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	CHRM2	P08172	466 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	VIPR2	P41587	438 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	GRIA3	P42263	894 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	NDUFV1	P49821	464 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	WNT3	P56703	355 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	TUBB3	Q13509	450 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	LRRC41	Q15345	812 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	CCDC157	Q569K6	752 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	PSMD1	Q99460	953 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	AOX1	Q06278	1338 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	LINC00473	A8K010	186 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	ADM5	C9JUS6	153 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753		M0QYG6	137 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	IKBKB	O14920	756 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms