RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SOBP	A7XYQ1	873 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RASA4B	C9J798	803 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	C2CD2L	O14523	706 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RASA4	O43374	803 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	LIAS	O43766	372 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ENTPD3	O75355	529 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DCTN3	O75935	186 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	GDF11	O95390	407 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	GH2	P01242	217 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CALCA	P01258	141 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RALA	P11233	206 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP6V1C1	P21283	382 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MAPK4	P31152	587 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RARRES1	P49788	294 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	HSD17B4	P51659	736 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CACNB3	P54284	484 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	INHBE	P58166	350 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TAS2R40	P59535	323 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	OCRL	Q01968	901 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CYP24A1	Q07973	514 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SPARCL1	Q14515	664 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SETDB1	Q15047	1291 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TMED2	Q15363	201 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TAF11	Q15544	211 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC1A5	Q15758	541 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	EFHC2	Q5JST6	749 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DACT2	Q5SW24	774 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	KRT39	Q6A163	491 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	LONP2	Q86WA8	852 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF677	Q86XU0	584 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ALLC	Q8N6M5	410 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC89	Q8N998	374 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	EXD1	Q8NHP7	514 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	FBXO41	Q8TF61	875 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MZB1	Q8WU39	189 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	KIFAP3	Q92845	792 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM136A	Q96C01	138 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ERP27	Q96DN0	273 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SPDL1	Q96EA4	605 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	IFT43	Q96FT9	208 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TTC25	Q96NG3	672 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NT5C1B	Q96P26	610 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	IWS1	Q96ST2	819 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MIPEP	Q99797	713 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC77	Q9BR77	488 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SENP1	Q9P0U3	644 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	FETUB	Q9UGM5	382 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TBX20	Q9UMR3	447 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ASB3	Q9Y575	518 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		5.25	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CLUH	O75153	1309 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		5.24	□□□□□ -1.57

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