RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515564.5

GATB-212, Transcript of glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B, humanhuman

TSL 2

Gene GATB, Length 6,552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATB-212ENST00000515564 STK33Q9BYT3 514 aa8.7□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 MTMR12Q9C0I1 747 aa8.7□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 CBX4O00257 560 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 NFIBO00712 420 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 OGTO15294 1046 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 PPIL2Q13356 520 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 PDXDC1Q6P996 788 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 PITPNM3Q9BZ71 974 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 GPRC5CQ9NQ84 441 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 TXLNGQ9NUQ3 528 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 ARP10275 920 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 FGFR2P21802 821 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 PMS2P54278 862 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 ESRRGP62508 458 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 CALML6Q8TD86 181 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 SENP2Q9HC62 589 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 PMPCBO75439 489 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 HIF1AQ16665 826 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 UGT3A1Q6NUS8 523 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 ARHGEF26Q96DR7 871 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 SPACA7Q96KW9 195 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 APPL1Q9UKG1 709 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 E2F8A0AVK6 867 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 FGFR1P11362 822 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 NUGGCQ68CJ6 796 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 FRMD3A2A2Y4 597 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 SYCE1LA8MT33 242 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 RPA1P27694 616 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 GRK3P35626 688 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 JADE3Q92613 823 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 UBXN6Q9BZV1 441 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 PKD2L2Q9NZM6 624 aa8.69□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 FOXN1O15353 648 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 CTSEP14091 401 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 CYP11B2P19099 503 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 TNNI3P19429 210 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 NCAPHQ15003 741 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 KLHL29Q96CT2 875 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 ZNF558Q96NG5 402 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 WWOXQ9NZC7 414 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 FHOD1Q9Y613 1164 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 LMNAP02545 664 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 TTLL9Q3SXZ7 439 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 EPC2Q52LR7 807 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 C7orf61Q8IZ16 206 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 SPATA18Q8TC71 538 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 NRBF2Q96F24 287 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 TRIM9Q9C026 710 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 TEX33O43247 280 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 PGK1P00558 417 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 SLC45A4Q5BKX6 768 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 UNC45BQ8IWX7 931 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 CYTH2Q99418 400 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 C17orf75Q9HAS0 396 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 SPG21Q9NZD8 308 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 TBC1D3BA6NDS4 549 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 VWA5AO00534 786 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 PRKAA1Q13131 559 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 PTK6Q13882 451 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 UGP2Q16851 508 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 IQSEC1Q6DN90 963 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 STOX1Q6ZVD7 989 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 SLC35G2Q8TBE7 412 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 DPF2Q92785 391 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 ADAM2Q99965 735 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 TASP1Q9H6P5 420 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 GPRC5DQ9NZD1 345 aa8.68□□□□□ -1.02
GATB-212ENST00000515564 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa8.68□□□□□ -1.02
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