RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 USP28Q96RU2 1077 aa20.71■□□□□ 0.91
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SH3BP2-220ENST00000511663 EBF3Q9H4W6 596 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-220ENST00000511663 TRPC7Q9HCX4 862 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-220ENST00000511663 INTS13Q9NVM9 706 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-220ENST00000511663 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-220ENST00000511663 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A087X0B3 334 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP6R2O75170 966 aa20.65■□□□□ 0.9
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