RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC7A14Q8TBB6 771 aa14.29□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 SPATA18Q8TC71 538 aa14.29□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 RTP3Q9BQQ7 232 aa14.29□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 ACBD6Q9BR61 282 aa14.29□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 MED10Q9BTT4 135 aa14.29□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa14.29□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 DZANK1Q9NVP4 752 aa14.29□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 CDH9Q9ULB4 789 aa14.29□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 TSC2P49815 1807 aa14.29□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.29□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 LGALS16A8MUM7 142 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 PMM2O15305 246 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 ATP2C2O75185 946 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 KRT5P13647 590 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 USP8P40818 1118 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 MGAT5BQ3V5L5 792 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 PPM1LQ5SGD2 360 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 TPGS2Q68CL5 300 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC149Q6ZUS6 474 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 ACOT1Q86TX2 421 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 TTC39CQ8N584 583 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 VN1R2Q8NFZ6 395 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF461Q8TAF7 563 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 TNIP3Q96KP6 325 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 BCO2Q9BYV7 579 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 HSD3B7Q9H2F3 369 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 DPEP3Q9H4B8 488 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 PIDD1Q9HB75 910 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 CISHQ9NSE2 258 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-204ENST00000503638 GABRDO14764 452 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 TBC1D4O60343 1298 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 GLP2RO95838 553 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 LRG1P02750 347 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 C8AP07357 584 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 PON1P27169 355 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 MFAP3P55082 362 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 APBA1Q02410 837 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 GPR17Q13304 367 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 ADAM15Q13444 863 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 ARHGAP44Q17R89 818 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 GJB7Q6PEY0 223 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 C4orf50Q6ZRC1 276 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 MYLPFQ96A32 169 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM49BQ9NUQ9 324 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 APEX2Q9UBZ4 518 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 ATP8B3O60423 1300 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 MTMR11A4FU01 709 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM86C2PA6NEL3 165 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 CCL16O15467 120 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 TBX10O75333 385 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM163BP0C2L3 166 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 ATF2P15336 505 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 CD19P15391 556 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 ALDH1A3P47895 512 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 FANCCQ00597 558 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 DUSP4Q13115 394 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 SYCP1Q15431 976 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 TAF12Q16514 161 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC142Q17RM4 750 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM31Q5JXX7 168 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 CES5AQ6NT32 575 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM270Q6UE05 265 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 LIMS2Q7Z4I7 341 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 UNC93AQ86WB7 457 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-204ENST00000503638 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms