RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496015.5

ABCD4-217, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 5

Gene ABCD4, Length 1,248 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-217ENST00000496015 SPATA32Q96LK8 384 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 TASP1Q9H6P5 420 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 SLC39A2Q9NP94 309 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 CLIC2O15247 247 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 CHADO15335 359 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 TGFB1I1O43294 461 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 LAMTOR5O43504 91 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 MYL1P05976 194 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 CSH1P0DML2 217 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 CSH2P0DML3 217 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 CASP1P29466 404 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 RPS9P46781 194 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 CDR1P51861 262 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 PSMD2Q13200 908 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 CUL4BQ13620 913 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 PSMD6Q15008 389 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 BMT2Q1RMZ1 405 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 FAM3CQ92520 227 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 MSANTD3Q96H12 275 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 PI4K2AQ9BTU6 479 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 EXOC1Q9NV70 894 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 OBP2AQ9NY56 170 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 PIAS3Q9Y6X2 628 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 PRR23AA6NEV1 266 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 GABRDO14764 452 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 EXOC3O60645 756 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 LRRN2O75325 713 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 SP9P0CG40 484 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 WEE1P30291 646 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 CYP24A1Q07973 514 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 TRPC3Q13507 836 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 SOWAHAQ2M3V2 549 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 STXBP5Q5T5C0 1151 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 C4orf50Q6ZRC1 276 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 C12orf56Q8IXR9 622 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 CLDN23Q96B33 292 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 PAGE5Q96GU1 130 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 FAM84AQ96KN4 292 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 MMS19Q96T76 1030 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 CGRRF1Q99675 332 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 PTPRJQ12913 1337 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 PATJQ8NI35 1801 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 VPS13AQ96RL7 3174 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 SOBPA7XYQ1 873 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 PHACTR2O75167 634 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 PFKFB1P16118 471 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 CYP2F1P24903 491 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 AVPR1AP37288 418 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 TNNC1P63316 161 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 PLCB2Q00722 1185 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 FCHO2Q0JRZ9 810 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 ZNF528Q3MIS6 628 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 ASCL5Q7RTU5 278 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 IER2Q9BTL4 223 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 SNX25Q9H3E2 840 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 IL21Q9HBE4 155 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 FBXO4Q9UKT5 387 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 CDH9Q9ULB4 789 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.61□□□□□ -0.07
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ABCD4-217ENST00000496015 A0A1B0GVL5 298 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 KIF20AO95235 890 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 FAM163BP0C2L3 166 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 WARSP23381 471 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 SYKP43405 635 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 AP3M2P53677 418 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 NLRP12P59046 1061 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 CYP4F8P98187 520 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 PPP2R5DQ14738 602 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.6□□□□□ -0.07
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