RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493601.5

PTPRU-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRU, Length 695 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-208ENST00000493601 MYL7Q01449 175 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 DGKKQ5KSL6 1271 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 CMTM8Q8IZV2 173 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 GPD1LQ8N335 351 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 SPEM1Q8N4L4 309 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 MTMR12Q9C0I1 747 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 CUEDC2Q9H467 287 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 PCIF1Q9H4Z3 704 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 FOXD4L1Q9NU39 408 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 GDAP2Q9NXN4 497 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 GTSE1Q9NYZ3 720 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 CEP250Q9BV73 2442 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 CSH1P0DML2 217 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 CSH2P0DML3 217 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 RBP5P82980 135 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 SATB1Q01826 763 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 TOP6BLQ8N6T0 577 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 LINC00301Q8NCQ3 95 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 TTC8Q8TAM2 541 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 CXorf38Q8TB03 319 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 PI4K2AQ9BTU6 479 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 SLC46A2Q9BY10 475 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 KIF9Q9HAQ2 790 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 PDE11AQ9HCR9 933 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 TMLHEQ9NVH6 421 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 GMEB2Q9UKD1 530 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 RAB23Q9ULC3 237 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 SNX9Q9Y5X1 595 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 SOBPA7XYQ1 873 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 SPTLC2O15270 562 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 PPP6R2O75170 966 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 PCSK1P29120 753 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 LHX1P48742 406 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 TNK2Q07912 1038 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 MYO1EQ12965 1108 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 GAS6Q14393 721 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 TXNDC11Q6PKC3 985 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 TMEM150AQ86TG1 271 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 ADGRF2Q8IZF7 708 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 MAB21L3Q8N8X9 362 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 SIX4Q9UIU6 781 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 TNNC2P02585 160 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 F11P03951 625 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 AMPD3Q01432 767 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 PON2Q15165 354 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 SURF1Q15526 300 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 Q6ZS52 159 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 SYNPOQ8N3V7 929 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 PKMYT1Q99640 499 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 BACH2Q9BYV9 841 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 TRIM9Q9C026 710 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 INTS13Q9NVM9 706 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 KBTBD4Q9NVX7 518 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRU-208ENST00000493601 ZNF233A6NK53 670 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP17.83■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 YEATS4O95619 227 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 SDHBP21912 280 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 CYP2F1P24903 491 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 GPR15P49685 360 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 ASIC1P78348 528 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 CCINQ13939 588 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 E2F4Q16254 413 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 CFAP221Q4G0U5 840 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 WDR44Q5JSH3 913 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 LAIR1Q6GTX8 287 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP17.83■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 FAM84AQ96KN4 292 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 KIAA1586Q9HCI6 787 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 TDP1Q9NUW8 608 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 DLL3Q9NYJ7 618 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 HSPBP1Q9NZL4 362 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 CCL26Q9Y258 94 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 UBE4BO95155 1302 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 PTPRJQ12913 1337 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 GABRDO14764 452 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 NOL4O94818 638 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 LMNB2Q03252 620 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRU-208ENST00000493601 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms