RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 PSEN2P49810 448 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 PLTPP55058 493 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 OSTNP61366 133 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 GNGT1P63211 74 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 DR1Q01658 176 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 NAA25Q14CX7 972 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 TMEM63BQ5T3F8 832 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 TMEM270Q6UE05 265 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 OR5B17Q8NGF7 314 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 BADQ92934 168 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 PCYT2Q99447 389 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 GPR20Q99678 358 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 SH3GL2Q99962 352 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ZSWIM1Q9BR11 485 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ETAA1Q9NY74 926 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ANAPC7Q9UJX3 599 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 UMODL1Q5DID0 1318 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 GOLGA8KD6RF30 607 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 FGBP02675 491 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 GZMAP12544 262 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CYP2B6P20813 491 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 RRM1P23921 792 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ENPEPQ07075 957 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CUL1Q13616 776 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 FAM187BQ17R55 369 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ZNF394Q53GI3 561 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CEP57Q86XR8 500 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 HERC6Q8IVU3 1022 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 PPP1R16BQ96T49 567 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 RAD9AQ99638 391 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 TMEM175Q9BSA9 504 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CAPS2Q9BXY5 557 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 MYADML2A6NDP7 307 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ARIH2O95376 493 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 GJB6O95452 261 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 TNFSF9P41273 254 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ADCYAP1R1P41586 468 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 SNX1Q13596 522 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CAPSQ13938 189 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 HSDL1Q3SXM5 330 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 SEL1L2Q5TEA6 688 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 PRELID2Q8N945 189 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 COPS5Q92905 334 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 TOP1MTQ969P6 601 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 C11orf70Q9BRQ4 267 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 PBX4Q9BYU1 374 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 TRPV6Q9H1D0 765 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 HSFX1Q9UBD0 423 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 SMIM23A6NLE4 172 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CLDN3O15551 220 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 VNN1O95497 513 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CD58P19256 250 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 IRAK1P51617 712 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 PTENP60484 403 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 WDR5P61964 334 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 TMEM132AQ24JP5 1023 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ZACNQ401N2 412 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ACAD10Q6JQN1 1059 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 JAMLQ86YT9 394 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CCDC105Q8IYK2 499 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 SH3GL3Q99963 347 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 AZI2Q9H6S1 392 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 RGS18Q9NS28 235 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 NRBP2Q9NSY0 501 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 MSRAQ9UJ68 235 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 USTQ9Y2C2 406 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GUA9 196 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 GOLGA6L10A6NI86 522 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
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