RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492259.6

RTEL1-TNFRSF6B-203, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,824 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 THRAP10827 490 aa16.04■□□□□ 0.16
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RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 CENPPQ6IPU0 288 aa16.04■□□□□ 0.16
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RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
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RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 ZBTB39O15060 712 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 C21orf2O43822 256 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 MYO1DO94832 1006 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 OSTNP61366 133 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 COBLL1Q53SF7 1204 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 CAPSLQ8WWF8 208 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 FAM111AQ96PZ2 611 aa16.02■□□□□ 0.15
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RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 TAGLN3Q9UI15 199 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 MED26O95402 600 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 ASNSP08243 561 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 RARGP13631 454 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 HAUS6Q7Z4H7 955 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 SLC10A4Q96EP9 437 aa16.02■□□□□ 0.15
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